27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2735 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  100 
 
 		 460 aa  939    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  32.43 
 
 		 987 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2737  hypothetical protein  42.65 
 
 		 246 aa  92.8  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000267628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.19 
 
 		 710 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.55 
 
 		 1842 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  33.6 
 
 		 1882 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  31.43 
 
 		 1732 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  31.09 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  32.54 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.73 
 
 		 1107 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  27.89 
 
 		 848 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1052 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  31.19 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  24.14 
 
 		 1041 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  30.77 
 
 		 458 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.13 
 
 		 1227 aa  53.1  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  43.66 
 
 		 657 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  26.26 
 
 		 1518 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  31.22 
 
 		 2392 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  26.15 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1014  hypothetical protein  26.81 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  47.17 
 
 		 842 aa  47  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  29.83 
 
 		 290 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  26.5 
 
 		 933 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  23.58 
 
 		 862 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  29.41 
 
 		 898 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1247 aa  43.5  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>