33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1983 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  100 
 
 		 987 aa  2014    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2313  hypothetical protein  47.83 
 
 		 834 aa  234  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  28.14 
 
 		 842 aa  194  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1023 aa  185  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1003 aa  167  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  32.71 
 
 		 460 aa  167  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2737  hypothetical protein  44.96 
 
 		 246 aa  110  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000267628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  34.51 
 
 		 1732 aa  72  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  30.73 
 
 		 1842 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  32.97 
 
 		 848 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.95 
 
 		 710 aa  65.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  34.74 
 
 		 1882 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  30.89 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  30.57 
 
 		 355 aa  55.5  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.66 
 
 		 1227 aa  53.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  31.33 
 
 		 2392 aa  52  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1052 aa  49.7  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  40 
 
 		 361 aa  48.9  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  32.09 
 
 		 461 aa  48.5  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  37.78 
 
 		 395 aa  48.5  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  37.17 
 
 		 465 aa  48.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1247 aa  47.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  22.64 
 
 		 731 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.76 
 
 		 462 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  34.78 
 
 		 541 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  22.09 
 
 		 1041 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  37.78 
 
 		 433 aa  45.8  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  30.33 
 
 		 476 aa  45.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  31.25 
 
 		 435 aa  45.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  28.32 
 
 		 414 aa  45.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  31.71 
 
 		 933 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  31.87 
 
 		 452 aa  45.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  32.41 
 
 		 483 aa  44.3  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>