30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1246 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  100 
 
 		 842 aa  1713    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  69.25 
 
 		 1003 aa  548  1e-154  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  28.02 
 
 		 987 aa  210  9e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1023 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2313  hypothetical protein  36.08 
 
 		 834 aa  180  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  34.07 
 
 		 657 aa  70.1  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  29.31 
 
 		 2192 aa  60.8  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  36.46 
 
 		 1332 aa  52.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.27 
 
 		 852 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  29.32 
 
 		 1755 aa  52.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  27.59 
 
 		 863 aa  51.6  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  44 
 
 		 350 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  44.26 
 
 		 1318 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  28.65 
 
 		 799 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29.13 
 
 		 575 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.93 
 
 		 2160 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  28.01 
 
 		 1619 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  46.6 
 
 		 460 aa  47  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  27.16 
 
 		 483 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.06 
 
 		 2031 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.5 
 
 		 1800 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1263 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  29.29 
 
 		 465 aa  45.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.66 
 
 		 884 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  25.83 
 
 		 759 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  40.45 
 
 		 361 aa  44.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.79 
 
 		 1037 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  36.94 
 
 		 541 aa  44.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  34.85 
 
 		 435 aa  44.3  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1106 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>