69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2925 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 
462 aa  905    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  55.44 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  55.2 
 
 
459 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.65 
 
 
464 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.09 
 
 
465 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  53.26 
 
 
454 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.56 
 
 
479 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  52.67 
 
 
459 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  51.88 
 
 
462 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  51.59 
 
 
454 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  53.22 
 
 
432 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  51.52 
 
 
467 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  53.19 
 
 
464 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  52.87 
 
 
455 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  55 
 
 
450 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  50.32 
 
 
464 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  50.94 
 
 
461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  52.03 
 
 
461 aa  352  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  50.94 
 
 
468 aa  349  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  51.36 
 
 
460 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  48.53 
 
 
493 aa  343  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  52.71 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  48.72 
 
 
454 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  52.06 
 
 
476 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  48.94 
 
 
452 aa  336  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  45.54 
 
 
505 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  53.08 
 
 
457 aa  333  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  51.04 
 
 
557 aa  333  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  50.21 
 
 
462 aa  332  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  52.15 
 
 
496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  48.01 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  52.65 
 
 
446 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  50.92 
 
 
489 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  49.79 
 
 
477 aa  319  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  50.32 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  46.28 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  51.27 
 
 
448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.68 
 
 
478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  47.05 
 
 
466 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  47.98 
 
 
435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  51.08 
 
 
361 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  53.2 
 
 
415 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  48.31 
 
 
464 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  51.03 
 
 
433 aa  296  7e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  50.47 
 
 
435 aa  293  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  47.49 
 
 
473 aa  292  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  36.63 
 
 
509 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  37.47 
 
 
523 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  35.99 
 
 
476 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  39.24 
 
 
481 aa  169  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  37.97 
 
 
483 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  35.83 
 
 
532 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  36.76 
 
 
477 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.58 
 
 
483 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  39.4 
 
 
501 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.06 
 
 
477 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  40.21 
 
 
673 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  40 
 
 
840 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  37.88 
 
 
168 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.08 
 
 
530 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.71 
 
 
1037 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.41 
 
 
767 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  32.76 
 
 
987 aa  47.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  29.85 
 
 
2160 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 
717 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.07 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  29.71 
 
 
527 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.67 
 
 
1061 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  38.75 
 
 
294 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>