163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1758 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  100 
 
 
933 aa  1925    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  42.9 
 
 
634 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  32.85 
 
 
1575 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  39.85 
 
 
558 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  33.03 
 
 
2670 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  34.98 
 
 
647 aa  314  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  31.99 
 
 
741 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  30.73 
 
 
609 aa  258  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  30.71 
 
 
2415 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  31.7 
 
 
3060 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  48.65 
 
 
857 aa  189  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  41.41 
 
 
399 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  43.66 
 
 
300 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  43.22 
 
 
789 aa  174  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  35.22 
 
 
395 aa  172  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  39.57 
 
 
323 aa  173  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  39.04 
 
 
486 aa  171  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  41.49 
 
 
800 aa  171  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  42.72 
 
 
497 aa  169  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  44.02 
 
 
250 aa  167  8e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  43.37 
 
 
250 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  41.67 
 
 
427 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  41.08 
 
 
862 aa  164  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  34.47 
 
 
862 aa  161  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  34.64 
 
 
331 aa  161  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  41.55 
 
 
500 aa  160  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  42.93 
 
 
1038 aa  157  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  46.34 
 
 
226 aa  156  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  42.08 
 
 
251 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  40.35 
 
 
754 aa  154  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  38.5 
 
 
309 aa  153  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  50.67 
 
 
173 aa  152  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  35.51 
 
 
377 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  42.23 
 
 
934 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  44.05 
 
 
762 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  38.35 
 
 
774 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  43.35 
 
 
272 aa  145  4e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.88 
 
 
1227 aa  144  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  37.19 
 
 
907 aa  144  9.999999999999999e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  29.2 
 
 
898 aa  144  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  38.98 
 
 
1214 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  39.55 
 
 
226 aa  140  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  38.1 
 
 
253 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  36.18 
 
 
399 aa  138  5e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  34.6 
 
 
452 aa  138  6.0000000000000005e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  37.82 
 
 
467 aa  137  8e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  41.18 
 
 
450 aa  135  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  39.8 
 
 
982 aa  135  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  39.11 
 
 
279 aa  134  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  32.39 
 
 
451 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  36.31 
 
 
414 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  35.16 
 
 
200 aa  125  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  45.31 
 
 
509 aa  124  8e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  49.24 
 
 
180 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  33.71 
 
 
275 aa  120  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  41.67 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  38.55 
 
 
521 aa  118  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  48.08 
 
 
913 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  38.46 
 
 
543 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  45.53 
 
 
560 aa  112  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  38.27 
 
 
369 aa  108  4e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  34.1 
 
 
408 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  30.5 
 
 
204 aa  106  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  36.97 
 
 
757 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  40.97 
 
 
321 aa  105  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  32.56 
 
 
1296 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  31.14 
 
 
996 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  35.8 
 
 
333 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  35.29 
 
 
700 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  39.16 
 
 
288 aa  97.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.1 
 
 
1055 aa  97.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
1015 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  34.68 
 
 
658 aa  97.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  34.64 
 
 
1174 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  33.75 
 
 
1437 aa  95.5  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  38.98 
 
 
190 aa  93.6  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  35.8 
 
 
446 aa  93.6  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  36.88 
 
 
166 aa  92.8  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  32.92 
 
 
336 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  36 
 
 
571 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  42.2 
 
 
228 aa  91.7  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  41.67 
 
 
236 aa  91.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  34.57 
 
 
491 aa  91.3  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  34.08 
 
 
1433 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.2 
 
 
665 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  31.9 
 
 
657 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  49.41 
 
 
182 aa  90.1  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  37.93 
 
 
371 aa  89.7  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  34.75 
 
 
646 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  29.91 
 
 
324 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  32.63 
 
 
1003 aa  88.6  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  32.2 
 
 
394 aa  88.2  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  33.87 
 
 
501 aa  87.8  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0308  hypothetical protein  40.21 
 
 
181 aa  86.3  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  30.05 
 
 
688 aa  86.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  41.41 
 
 
219 aa  85.9  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  51.25 
 
 
158 aa  84.7  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0737  hypothetical protein  30.64 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.442798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  35.9 
 
 
371 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0735  hypothetical protein  41.23 
 
 
415 aa  83.2  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>