More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3798 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  83.06 
 
 
748 aa  831    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  100 
 
 
1041 aa  2093    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  61.59 
 
 
1015 aa  942    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.34 
 
 
1107 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  40.74 
 
 
863 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  40.79 
 
 
892 aa  488  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  38.72 
 
 
867 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  38.3 
 
 
937 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  37.71 
 
 
925 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  38.05 
 
 
937 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  38.93 
 
 
886 aa  435  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  51.37 
 
 
482 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  27.93 
 
 
761 aa  260  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  45.72 
 
 
508 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  43.89 
 
 
1263 aa  246  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  44.8 
 
 
354 aa  237  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  43.16 
 
 
416 aa  234  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  44.1 
 
 
757 aa  214  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  26.08 
 
 
1085 aa  213  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  38.48 
 
 
713 aa  209  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  32.96 
 
 
1266 aa  195  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  27.72 
 
 
811 aa  187  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  39.15 
 
 
2491 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  35.56 
 
 
1749 aa  182  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  38.08 
 
 
1024 aa  155  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  41.67 
 
 
307 aa  147  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.33 
 
 
472 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  30.09 
 
 
1344 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  39.09 
 
 
296 aa  135  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  37.13 
 
 
242 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  40.82 
 
 
448 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.85 
 
 
476 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  41.96 
 
 
788 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  41.96 
 
 
788 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  40.33 
 
 
776 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  41.61 
 
 
788 aa  124  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  32.6 
 
 
2132 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  34.54 
 
 
467 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  36.97 
 
 
731 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  30.64 
 
 
802 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  40.09 
 
 
478 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  36.97 
 
 
755 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  36.97 
 
 
755 aa  112  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  35.94 
 
 
755 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  39.63 
 
 
447 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
447 aa  107  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  25.84 
 
 
558 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  32.1 
 
 
631 aa  105  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  29.83 
 
 
559 aa  106  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  31.18 
 
 
1744 aa  105  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 
453 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  31.27 
 
 
648 aa  103  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
436 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  28.78 
 
 
558 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  29.79 
 
 
569 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  37.04 
 
 
451 aa  101  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  32.19 
 
 
765 aa  101  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  33.71 
 
 
972 aa  101  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  32.68 
 
 
396 aa  101  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  34.67 
 
 
304 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  34.74 
 
 
447 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  43.54 
 
 
291 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
471 aa  99.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 
445 aa  100  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  37.39 
 
 
565 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  26.09 
 
 
528 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
460 aa  99.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  34.04 
 
 
446 aa  99.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  36.14 
 
 
451 aa  98.2  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
437 aa  97.8  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  35.54 
 
 
451 aa  97.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  36.42 
 
 
451 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
437 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  40.24 
 
 
475 aa  97.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
437 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  31.43 
 
 
204 aa  95.9  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  33.51 
 
 
446 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  30.92 
 
 
601 aa  96.3  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 
459 aa  95.9  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  33.33 
 
 
434 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
412 aa  96.3  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
439 aa  95.5  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  32.12 
 
 
716 aa  95.1  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  35.71 
 
 
247 aa  94  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
441 aa  94.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
414 aa  94  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  40.89 
 
 
258 aa  93.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  34.26 
 
 
685 aa  93.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
439 aa  93.6  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  34.48 
 
 
484 aa  92.8  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
437 aa  92  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  29.08 
 
 
580 aa  92  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  34.34 
 
 
413 aa  92  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
421 aa  92  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
445 aa  91.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  31.75 
 
 
499 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  33.01 
 
 
414 aa  91.7  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  32.35 
 
 
384 aa  91.3  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 
440 aa  90.5  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
469 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>