176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2142 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
439 aa  908    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  53.21 
 
 
437 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  51.38 
 
 
441 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  52.52 
 
 
437 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  52.52 
 
 
437 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  51.38 
 
 
460 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  50.91 
 
 
445 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  52.78 
 
 
469 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  51.97 
 
 
471 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  50.8 
 
 
445 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  48.51 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  47.11 
 
 
434 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  47.02 
 
 
437 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  44.97 
 
 
475 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  46.26 
 
 
447 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
453 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  46.12 
 
 
436 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  46.86 
 
 
412 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  45.16 
 
 
447 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  46.88 
 
 
446 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  45.8 
 
 
447 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  47.77 
 
 
414 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  48.26 
 
 
413 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  47.5 
 
 
396 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  43.62 
 
 
459 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  46.67 
 
 
436 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  45.27 
 
 
451 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  43.75 
 
 
490 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  45.68 
 
 
438 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  44.82 
 
 
451 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  45.65 
 
 
414 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 
441 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  44.57 
 
 
451 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  43.68 
 
 
451 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  43.12 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  44.58 
 
 
421 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  42.67 
 
 
464 aa  352  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  45.24 
 
 
499 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  47.93 
 
 
440 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  43.06 
 
 
444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  45.15 
 
 
439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  42.2 
 
 
432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  46.63 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 
444 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  41.71 
 
 
473 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  40.92 
 
 
437 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  38.85 
 
 
484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  37.75 
 
 
432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.4 
 
 
1041 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.85 
 
 
508 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.23 
 
 
1263 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  35.52 
 
 
416 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35.56 
 
 
892 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  34.09 
 
 
482 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.05 
 
 
937 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.05 
 
 
937 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.58 
 
 
1107 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  32.12 
 
 
1015 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.02 
 
 
867 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.95 
 
 
863 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.98 
 
 
761 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  33.15 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  31.82 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.34 
 
 
886 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.23 
 
 
1749 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.69 
 
 
713 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  23.87 
 
 
757 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  30.3 
 
 
296 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.08 
 
 
472 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.06 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  25.58 
 
 
242 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  27.67 
 
 
204 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.47 
 
 
305 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  29.69 
 
 
528 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  29.88 
 
 
802 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28.3 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.74 
 
 
476 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  38.55 
 
 
744 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  27.27 
 
 
2324 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  28.88 
 
 
247 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  31.93 
 
 
980 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  31.76 
 
 
1744 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  27.72 
 
 
580 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  28.89 
 
 
1393 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  32.16 
 
 
230 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  23.05 
 
 
1344 aa  53.9  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  31.82 
 
 
443 aa  53.9  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  31 
 
 
675 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.93 
 
 
1395 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  26.37 
 
 
263 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.38 
 
 
531 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  32 
 
 
108 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  24.9 
 
 
559 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  29.19 
 
 
2491 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  26.18 
 
 
286 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1527  Serine/threonine protein kinase-like  26.03 
 
 
672 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  25.27 
 
 
640 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  25.75 
 
 
291 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  35.14 
 
 
854 aa  50.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  29.22 
 
 
293 aa  50.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>