252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1090 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 441 aa  905    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  61.31 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  60.86 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  58.69 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  59.23 
 
 		 453 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  57.18 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  56.95 
 
 		 451 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  58.49 
 
 		 446 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  56.49 
 
 		 451 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  56.04 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  54.24 
 
 		 475 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  53.6 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  51.22 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  50.72 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 		 412 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  50.97 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  50.72 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  50.63 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  51.49 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  50.74 
 
 		 421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  47.61 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  47.43 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  46.52 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  50.25 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  48.96 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  46.98 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  47.13 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  45.5 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  49.38 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  46.26 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  45.62 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 		 439 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  45.07 
 
 		 438 aa  362  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  46.35 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  45.1 
 
 		 499 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  45.3 
 
 		 450 aa  329  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 		 432 aa  328  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  42.73 
 
 		 444 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  41.96 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  42.33 
 
 		 444 aa  317  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 		 473 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 		 437 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  35.38 
 
 		 432 aa  237  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  33.26 
 
 		 484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.46 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  35.29 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  36.9 
 
 		 1041 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.34 
 
 		 863 aa  87  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.86 
 
 		 1263 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  37.04 
 
 		 1015 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.73 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  33.53 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.18 
 
 		 937 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.18 
 
 		 937 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  32.6 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.64 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.59 
 
 		 1107 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.12 
 
 		 892 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.76 
 
 		 867 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  35.03 
 
 		 713 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.13 
 
 		 757 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  27.62 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  36.15 
 
 		 761 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.33 
 
 		 305 aa  67  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.93 
 
 		 886 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25.42 
 
 		 1749 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  30.87 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.94 
 
 		 1344 aa  64.3  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.82 
 
 		 1024 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  33.1 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  28.41 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.13 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.62 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  35.19 
 
 		 980 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.73 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  24.19 
 
 		 925 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.33 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  30.4 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  32.56 
 
 		 791 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  32.56 
 
 		 535 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  32.76 
 
 		 565 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  28.22 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  42.86 
 
 		 854 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  26.38 
 
 		 528 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  30 
 
 		 558 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06250  MAP kinase kinase kinase, putative  28.49 
 
 		 1451 aa  53.9  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  30.57 
 
 		 2324 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  31.4 
 
 		 615 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  27.98 
 
 		 755 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  27.59 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 612 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  35.61 
 
 		 284 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  28.3 
 
 		 293 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>