180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3397 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
444 aa  859    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  83.33 
 
 
444 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  96.4 
 
 
473 aa  810    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  70.62 
 
 
439 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  67.58 
 
 
437 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  66.44 
 
 
432 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  54.78 
 
 
434 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  54.97 
 
 
446 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  54.82 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  53.55 
 
 
437 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  51.37 
 
 
440 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  56.64 
 
 
499 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  55.53 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 
437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 
437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  55.66 
 
 
471 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  55.89 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  57.66 
 
 
440 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  53.35 
 
 
441 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  57.87 
 
 
450 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  53.88 
 
 
438 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  52.07 
 
 
445 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  51.47 
 
 
445 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  51.87 
 
 
464 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  44.47 
 
 
447 aa  346  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  43.66 
 
 
414 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  43.44 
 
 
453 aa  342  8e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  44.55 
 
 
447 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
447 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  44.89 
 
 
451 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  44.44 
 
 
451 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  44.44 
 
 
451 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  44.42 
 
 
446 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 
439 aa  333  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  44.22 
 
 
451 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  41.29 
 
 
436 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 
475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  44.67 
 
 
421 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  43.52 
 
 
413 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  43.14 
 
 
412 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  42.33 
 
 
441 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  42.93 
 
 
414 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 
459 aa  318  9e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  41.27 
 
 
396 aa  312  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  40.85 
 
 
490 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  37.05 
 
 
432 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  38.94 
 
 
484 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  37.21 
 
 
416 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.5 
 
 
937 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.5 
 
 
937 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.35 
 
 
757 aa  89.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  36.73 
 
 
1263 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.09 
 
 
863 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.04 
 
 
892 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.76 
 
 
1041 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.53 
 
 
867 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.22 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.89 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.73 
 
 
1015 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32.42 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  35 
 
 
354 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.38 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.82 
 
 
1107 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  32.8 
 
 
307 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  31.52 
 
 
761 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.9 
 
 
886 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  25.73 
 
 
713 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  32.7 
 
 
528 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.47 
 
 
296 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.38 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  28 
 
 
528 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.63 
 
 
476 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.95 
 
 
1749 aa  60.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  32.75 
 
 
1024 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  33.08 
 
 
791 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  28.48 
 
 
448 aa  57  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  32.12 
 
 
443 aa  56.6  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.21 
 
 
653 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  30.32 
 
 
580 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  29.34 
 
 
1088 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  30.34 
 
 
230 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  35.34 
 
 
675 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  37.93 
 
 
2132 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  29.9 
 
 
647 aa  54.3  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  25.5 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46664  predicted protein  29.31 
 
 
554 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523467  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  33.82 
 
 
478 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  28.29 
 
 
972 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  26.02 
 
 
980 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  36.43 
 
 
648 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.83 
 
 
1344 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  30.73 
 
 
615 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  23.16 
 
 
467 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  32.68 
 
 
559 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  22.94 
 
 
263 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  31.58 
 
 
2198 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  33.13 
 
 
601 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  36.29 
 
 
473 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  26.49 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>