201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32300 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  100 
 
 
499 aa  981    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  81.55 
 
 
440 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  62.09 
 
 
434 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  59.68 
 
 
440 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  59.86 
 
 
437 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  60.46 
 
 
445 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  59.82 
 
 
446 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  59.08 
 
 
445 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  60.91 
 
 
436 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  59.82 
 
 
460 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  56.26 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  57.63 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  57.8 
 
 
441 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  58.03 
 
 
437 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  58.03 
 
 
437 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  58.03 
 
 
437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  56.58 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  58.37 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  59.95 
 
 
450 aa  428  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  56.64 
 
 
444 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  57.11 
 
 
444 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  55.94 
 
 
473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  56.15 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  56.34 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  47.77 
 
 
446 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  45.8 
 
 
459 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  48.53 
 
 
447 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  45.7 
 
 
475 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  46.44 
 
 
447 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  48.3 
 
 
447 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  47.75 
 
 
451 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  55.01 
 
 
437 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  47.67 
 
 
451 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  48.23 
 
 
451 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  48.42 
 
 
451 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  46.49 
 
 
453 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  47.15 
 
 
412 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  45.1 
 
 
441 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 
439 aa  360  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  43.65 
 
 
490 aa  358  9e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  45.94 
 
 
414 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  46.97 
 
 
413 aa  353  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  44.7 
 
 
396 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  45.09 
 
 
414 aa  353  5e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  44.31 
 
 
436 aa  352  8.999999999999999e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 
421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  38.02 
 
 
484 aa  258  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  39.33 
 
 
432 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.66 
 
 
1263 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.75 
 
 
1041 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  37.64 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.89 
 
 
307 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  35.32 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  29.63 
 
 
892 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.61 
 
 
937 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.38 
 
 
863 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  35 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.61 
 
 
937 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.51 
 
 
508 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  32.46 
 
 
1015 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.54 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.83 
 
 
1107 aa  77.4  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.92 
 
 
867 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.34 
 
 
757 aa  73.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  32.3 
 
 
755 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  29.28 
 
 
713 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.12 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32.93 
 
 
761 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  30.97 
 
 
765 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  26.84 
 
 
925 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.02 
 
 
886 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.18 
 
 
296 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.14 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  31 
 
 
755 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.98 
 
 
467 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  31 
 
 
755 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.08 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.26 
 
 
476 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51279  predicted protein  28.98 
 
 
298 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  30.81 
 
 
559 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.28 
 
 
1024 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  36.09 
 
 
675 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.42 
 
 
1749 aa  57.4  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  24.42 
 
 
791 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  33.71 
 
 
776 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.11 
 
 
1344 aa  53.5  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  29.59 
 
 
763 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  31.97 
 
 
648 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38832  predicted protein  29.52 
 
 
372 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00223865  hitchhiker  0.00603177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  27.45 
 
 
528 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  34.29 
 
 
788 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  29.38 
 
 
615 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  34.29 
 
 
788 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  35.61 
 
 
547 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  28.97 
 
 
291 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  23.68 
 
 
204 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  30 
 
 
622 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  24.4 
 
 
612 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 
653 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  34.29 
 
 
788 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>