124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4351 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1157    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  29.62 
 
 
802 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  26.96 
 
 
1088 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  26.05 
 
 
569 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.08 
 
 
1041 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  27.87 
 
 
482 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.07 
 
 
354 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.48 
 
 
508 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.29 
 
 
1107 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.22 
 
 
757 aa  87.4  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.27 
 
 
713 aa  84.3  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.41 
 
 
1263 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  28.54 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31 
 
 
1015 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  21.81 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  28.22 
 
 
925 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  29.32 
 
 
648 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  23.28 
 
 
863 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.98 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  27.6 
 
 
867 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  27.87 
 
 
1024 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.92 
 
 
1749 aa  69.3  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.22 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.91 
 
 
1344 aa  66.6  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.02 
 
 
653 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  26.19 
 
 
937 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  34 
 
 
149 aa  64.7  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  26.21 
 
 
937 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  27.19 
 
 
892 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
412 aa  63.5  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.02 
 
 
296 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.23 
 
 
476 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 
436 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  34.23 
 
 
886 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  20.09 
 
 
204 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.2 
 
 
472 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  27.05 
 
 
414 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  37.27 
 
 
761 aa  58.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  23.6 
 
 
242 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  27.16 
 
 
413 aa  57.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
473 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  38.46 
 
 
980 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  28.57 
 
 
396 aa  56.2  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
439 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  27.89 
 
 
656 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  26.49 
 
 
1012 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 
444 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  35.9 
 
 
1744 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  33.64 
 
 
447 aa  53.9  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  26.6 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  26.13 
 
 
558 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  27.14 
 
 
478 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  32.65 
 
 
2324 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  29.01 
 
 
451 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  26.24 
 
 
559 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 
451 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 
437 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  32.8 
 
 
291 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.56 
 
 
305 aa  51.2  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  34.09 
 
 
230 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  25.54 
 
 
434 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  25.4 
 
 
601 aa  50.4  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  30.77 
 
 
675 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  26.82 
 
 
972 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  28.98 
 
 
484 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  21.65 
 
 
2491 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  29.01 
 
 
451 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  37.78 
 
 
446 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  28.76 
 
 
558 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  31.49 
 
 
451 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  31.33 
 
 
1281 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2596  leucine-rich repeat-containing protein  36.49 
 
 
151 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  27.32 
 
 
543 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  33.07 
 
 
473 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10647  predicted protein  36.23 
 
 
75 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642206  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  29.94 
 
 
447 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 
459 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  31.03 
 
 
446 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  33.01 
 
 
438 aa  47.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  30.48 
 
 
225 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
414 aa  47.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  28.68 
 
 
237 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  25.76 
 
 
509 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  26.45 
 
 
448 aa  47.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
469 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  28.66 
 
 
528 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  26.6 
 
 
471 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  31.12 
 
 
222 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 
445 aa  47.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0946  hypothetical protein  29.29 
 
 
333 aa  47  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000225711 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
460 aa  47.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  23.18 
 
 
716 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  24.49 
 
 
247 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  40.28 
 
 
108 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.43 
 
 
2132 aa  47  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  36.59 
 
 
490 aa  47  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
447 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  41.57 
 
 
443 aa  47  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>