62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2596 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2596  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  40.23 
 
 		 1015 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  39.74 
 
 		 1749 aa  57.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  38.75 
 
 		 892 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.05 
 
 		 1107 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2827  BRCT domain-containing protein  35.51 
 
 		 796 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  36.78 
 
 		 1041 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2828  hypothetical protein  32.71 
 
 		 855 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  30.58 
 
 		 1344 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.41 
 
 		 416 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  34.67 
 
 		 713 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1498 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  37.97 
 
 		 482 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.46 
 
 		 307 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 		 1281 aa  48.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  40.51 
 
 		 1088 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  36.49 
 
 		 580 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.05 
 
 		 867 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  34.65 
 
 		 448 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  39.24 
 
 		 508 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1227  hypothetical protein  34 
 
 		 270 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  36.84 
 
 		 476 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  38.96 
 
 		 528 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  29.41 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  33.66 
 
 		 1496 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  32.05 
 
 		 2132 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  24.03 
 
 		 640 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  30.15 
 
 		 1611 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 475 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  40.74 
 
 		 886 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  35.71 
 
 		 757 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  39.71 
 
 		 247 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1744 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1269  leucine-rich repeat-containing protein  32.89 
 
 		 360 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.407419  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  37.5 
 
 		 601 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.77 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  34.09 
 
 		 528 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.86 
 
 		 1263 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  36.84 
 
 		 472 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  31.78 
 
 		 761 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  35.53 
 
 		 559 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  35 
 
 		 675 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  40.54 
 
 		 647 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  36.14 
 
 		 438 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  30.53 
 
 		 434 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  27.93 
 
 		 648 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  36.36 
 
 		 1290 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  32.67 
 
 		 1497 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 414 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  33.75 
 
 		 414 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  51.16 
 
 		 443 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.29 
 
 		 291 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 439 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10572  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02450)  34.57 
 
 		 543 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32.35 
 
 		 242 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  30.38 
 
 		 293 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  29.84 
 
 		 899 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  34.88 
 
 		 1439 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  28.4 
 
 		 980 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  37.31 
 
 		 1439 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  28.75 
 
 		 925 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>