126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4099 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1611 aa  3294    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  28.06 
 
 		 1634 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1631 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1498 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1496 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1497 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1640 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  26.59 
 
 		 1984 aa  345  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  26.26 
 
 		 2580 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1990 aa  339  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1395 aa  321  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  31.97 
 
 		 1395 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  30.82 
 
 		 1393 aa  291  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1439 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  30.16 
 
 		 1439 aa  286  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1473 aa  283  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1459 aa  281  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1376 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  29.4 
 
 		 1494 aa  272  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1498 aa  263  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1495 aa  258  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1481 aa  234  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1625 aa  231  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1690 aa  228  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1593 aa  223  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1481 aa  220  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1680 aa  220  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1508 aa  202  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1489 aa  192  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1473 aa  190  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1262 aa  184  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1744 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  27.82 
 
 		 971 aa  164  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1275 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1847 aa  147  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1608 aa  130  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  25.23 
 
 		 547 aa  86.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  29.36 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  26.08 
 
 		 568 aa  85.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  27.49 
 
 		 755 aa  84  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  27.49 
 
 		 755 aa  84  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  27.49 
 
 		 731 aa  84.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  25 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  26.82 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  26.85 
 
 		 615 aa  80.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  25.2 
 
 		 603 aa  79.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  27.22 
 
 		 545 aa  79.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  25.99 
 
 		 575 aa  78.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  26.07 
 
 		 583 aa  77.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  26.68 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  26.46 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  24.9 
 
 		 755 aa  75.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  26.68 
 
 		 788 aa  75.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  26.91 
 
 		 788 aa  75.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  26.85 
 
 		 765 aa  74.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  41.12 
 
 		 1041 aa  67.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  26.09 
 
 		 622 aa  66.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  31.63 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  34 
 
 		 482 aa  65.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.88 
 
 		 1107 aa  63.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.7 
 
 		 1263 aa  63.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.67 
 
 		 863 aa  63.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35 
 
 		 1015 aa  62.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.85 
 
 		 467 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  37.31 
 
 		 508 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 		 459 aa  57.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  26.7 
 
 		 886 aa  57  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  24.82 
 
 		 204 aa  56.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.08 
 
 		 937 aa  55.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  26.92 
 
 		 446 aa  55.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  29.15 
 
 		 416 aa  55.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  28.11 
 
 		 451 aa  55.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.08 
 
 		 937 aa  55.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.11 
 
 		 1749 aa  54.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.52 
 
 		 307 aa  54.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 		 475 aa  54.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  26.49 
 
 		 451 aa  53.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  32.79 
 
 		 230 aa  53.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  26.49 
 
 		 451 aa  52.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  24.58 
 
 		 1070 aa  52.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  24.58 
 
 		 1070 aa  52.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  29.38 
 
 		 757 aa  52.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.34 
 
 		 448 aa  52.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 447 aa  52.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 		 453 aa  52  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 		 451 aa  52  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.21 
 
 		 892 aa  51.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 447 aa  52  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  27.01 
 
 		 490 aa  50.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  23.93 
 
 		 1088 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  33.05 
 
 		 1344 aa  50.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 		 445 aa  50.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  33.93 
 
 		 347 aa  49.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  35.29 
 
 		 1266 aa  48.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.73 
 
 		 1024 aa  49.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.85 
 
 		 476 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  30.08 
 
 		 454 aa  48.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  33.04 
 
 		 925 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1351 aa  48.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>