52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3149 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  60.38 
 
 		 1625 aa  1888    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1680 aa  3412    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  96.49 
 
 		 1690 aa  3303    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  42.02 
 
 		 1489 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  27.91 
 
 		 1634 aa  296  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1262 aa  294  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  29.92 
 
 		 1984 aa  279  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1631 aa  279  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  26.3 
 
 		 2580 aa  258  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1275 aa  253  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1640 aa  243  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1990 aa  239  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  31.67 
 
 		 1497 aa  223  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1611 aa  220  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  30.16 
 
 		 1496 aa  211  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1498 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1498 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1593 aa  194  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1393 aa  188  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1473 aa  186  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  26 
 
 		 1608 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1395 aa  186  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  30.76 
 
 		 1495 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1473 aa  180  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1395 aa  172  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1847 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1439 aa  152  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1439 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1494 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  25 
 
 		 971 aa  136  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1481 aa  129  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1376 aa  128  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1481 aa  128  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1508 aa  123  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1744 aa  120  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1459 aa  115  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.61 
 
 		 508 aa  63.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.94 
 
 		 1263 aa  59.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.78 
 
 		 1041 aa  58.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.64 
 
 		 1015 aa  57.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  23.91 
 
 		 574 aa  54.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  28.94 
 
 		 354 aa  51.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  23.42 
 
 		 565 aa  50.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  22.41 
 
 		 547 aa  50.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  23.2 
 
 		 443 aa  49.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.97 
 
 		 867 aa  49.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.26 
 
 		 307 aa  48.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  22.08 
 
 		 603 aa  48.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  22.02 
 
 		 583 aa  46.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  28.48 
 
 		 432 aa  45.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  22.08 
 
 		 568 aa  45.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  23.19 
 
 		 575 aa  45.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>