79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4286 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  35.18 
 
 		 1640 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 2580 aa  5241    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  29.89 
 
 		 1984 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1990 aa  501  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  26.51 
 
 		 1634 aa  384  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1631 aa  365  9e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1611 aa  355  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1593 aa  303  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1680 aa  267  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1494 aa  265  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1690 aa  257  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  29.4 
 
 		 1847 aa  231  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1625 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  29.64 
 
 		 1439 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1393 aa  217  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1439 aa  214  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1497 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1496 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  28.2 
 
 		 1395 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1395 aa  199  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1262 aa  199  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1459 aa  199  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1498 aa  188  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1498 aa  184  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27 
 
 		 1495 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1489 aa  177  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1275 aa  169  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1744 aa  164  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1473 aa  164  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1608 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1473 aa  158  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  25.44 
 
 		 971 aa  155  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1376 aa  138  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1481 aa  125  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1481 aa  118  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1508 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.64 
 
 		 1107 aa  84.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.87 
 
 		 1263 aa  83.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  25.06 
 
 		 482 aa  74.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  23.18 
 
 		 757 aa  74.3  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.89 
 
 		 1041 aa  69.7  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  25.99 
 
 		 508 aa  68.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.82 
 
 		 892 aa  62  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.53 
 
 		 354 aa  61.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.33 
 
 		 1015 aa  60.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.13 
 
 		 863 aa  58.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  22.77 
 
 		 1344 aa  57.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.83 
 
 		 242 aa  56.6  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.08 
 
 		 472 aa  56.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.87 
 
 		 307 aa  55.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  33.99 
 
 		 490 aa  55.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  28.74 
 
 		 416 aa  55.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  29.57 
 
 		 1070 aa  53.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  29.57 
 
 		 1070 aa  53.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 473 aa  53.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  26.61 
 
 		 713 aa  53.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  25.87 
 
 		 559 aa  52.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  26.96 
 
 		 436 aa  52.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  26.53 
 
 		 886 aa  51.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  25.86 
 
 		 1024 aa  51.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.18 
 
 		 305 aa  52  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  33.12 
 
 		 761 aa  50.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.85 
 
 		 937 aa  50.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.46 
 
 		 1112 aa  50.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.77 
 
 		 291 aa  50.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  23.03 
 
 		 1749 aa  50.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  33.91 
 
 		 528 aa  50.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  25.73 
 
 		 396 aa  49.7  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.85 
 
 		 937 aa  49.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  23.52 
 
 		 528 aa  48.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.31 
 
 		 867 aa  49.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  23.61 
 
 		 204 aa  48.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  25.95 
 
 		 467 aa  48.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  26.09 
 
 		 925 aa  47.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  27.97 
 
 		 448 aa  47.4  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1085 aa  47  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  46.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  25.73 
 
 		 2324 aa  46.6  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  30.19 
 
 		 434 aa  46.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>