102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3108 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1593 aa  3229    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  31.75 
 
 		 2580 aa  306  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  29.1 
 
 		 1393 aa  303  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1439 aa  296  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1395 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1439 aa  284  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  33.16 
 
 		 971 aa  279  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1395 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  31.6 
 
 		 1640 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1262 aa  273  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1847 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1459 aa  267  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  29.99 
 
 		 1984 aa  266  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1990 aa  262  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1473 aa  248  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1608 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1275 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1744 aa  234  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1473 aa  233  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  27.48 
 
 		 1634 aa  232  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1498 aa  228  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1497 aa  228  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1611 aa  228  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1498 aa  227  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1631 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1496 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1494 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1690 aa  205  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1376 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1680 aa  202  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1625 aa  197  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  37.85 
 
 		 1489 aa  194  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1495 aa  172  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1481 aa  168  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1481 aa  160  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1508 aa  129  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.08 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.44 
 
 		 1263 aa  65.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.93 
 
 		 307 aa  63.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  26.44 
 
 		 925 aa  62.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.67 
 
 		 354 aa  61.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.91 
 
 		 472 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.32 
 
 		 1107 aa  60.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  22.17 
 
 		 713 aa  58.9  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.05 
 
 		 482 aa  58.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  25.32 
 
 		 757 aa  57  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 		 436 aa  56.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  27.27 
 
 		 528 aa  56.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.67 
 
 		 1344 aa  55.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  36.75 
 
 		 1370 aa  54.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  34.15 
 
 		 559 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  27.04 
 
 		 448 aa  53.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  30 
 
 		 980 aa  53.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 440 aa  53.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  24.26 
 
 		 204 aa  53.5  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.32 
 
 		 291 aa  53.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  36.36 
 
 		 273 aa  52.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  28.57 
 
 		 892 aa  52.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  32.59 
 
 		 440 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 437 aa  52  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  29.52 
 
 		 1088 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 439 aa  52  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  28.48 
 
 		 436 aa  50.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  24.69 
 
 		 296 aa  50.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  28.98 
 
 		 1041 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 444 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  27.87 
 
 		 937 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.58 
 
 		 476 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  27.32 
 
 		 937 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 437 aa  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 437 aa  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  25.43 
 
 		 863 aa  48.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 469 aa  48.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  30.08 
 
 		 499 aa  48.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.67 
 
 		 242 aa  48.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  23.35 
 
 		 467 aa  48.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  28.1 
 
 		 1070 aa  47.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  28.1 
 
 		 1070 aa  47.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 464 aa  47.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 444 aa  47.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  29.3 
 
 		 1088 aa  47.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 		 412 aa  47.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.41 
 
 		 1112 aa  47  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 		 744 aa  47  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.34 
 
 		 1749 aa  47  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  31.85 
 
 		 451 aa  46.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 		 471 aa  46.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  28.7 
 
 		 791 aa  46.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  34.21 
 
 		 643 aa  46.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 441 aa  46.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  32.59 
 
 		 451 aa  46.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  31.85 
 
 		 451 aa  46.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  29.07 
 
 		 528 aa  45.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 473 aa  45.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 437 aa  45.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  35.19 
 
 		 526 aa  45.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  31.09 
 
 		 761 aa  45.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  39.73 
 
 		 293 aa  45.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  29.76 
 
 		 413 aa  45.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  36.59 
 
 		 647 aa  45.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>