59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2494 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  100 
 
 		 1275 aa  2556    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  42.73 
 
 		 1262 aa  936    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1439 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1439 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1473 aa  272  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1489 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  30.64 
 
 		 1690 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  30.2 
 
 		 1680 aa  267  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1473 aa  265  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1459 aa  250  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1497 aa  249  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  30.64 
 
 		 1593 aa  239  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  29.51 
 
 		 1634 aa  238  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1498 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1625 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1481 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  28.17 
 
 		 1984 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  30.57 
 
 		 1631 aa  226  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1990 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1498 aa  224  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  28.16 
 
 		 1393 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  28.56 
 
 		 1608 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1496 aa  221  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1481 aa  221  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1395 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  26.31 
 
 		 1847 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1395 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1494 aa  206  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1495 aa  204  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1744 aa  191  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1508 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1640 aa  181  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  25.36 
 
 		 2580 aa  170  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.31 
 
 		 1611 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1376 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  25.97 
 
 		 971 aa  128  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.16 
 
 		 1041 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.52 
 
 		 1015 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.17 
 
 		 1107 aa  51.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  37.4 
 
 		 446 aa  50.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  27.57 
 
 		 482 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.73 
 
 		 892 aa  48.9  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.25 
 
 		 1344 aa  48.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  33.8 
 
 		 413 aa  48.5  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  28.57 
 
 		 1266 aa  47.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  31.03 
 
 		 622 aa  48.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  30 
 
 		 490 aa  47.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  24.83 
 
 		 296 aa  47.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  28.31 
 
 		 484 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.86 
 
 		 476 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  36.64 
 
 		 451 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  34.04 
 
 		 1088 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  46.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 		 436 aa  46.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  25.33 
 
 		 242 aa  46.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  30.46 
 
 		 318 aa  45.8  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.78 
 
 		 653 aa  45.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 		 451 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.35 
 
 		 1263 aa  45.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>