229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1882 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  36.18 
 
 		 1395 aa  710    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  35.34 
 
 		 1459 aa  692    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  35.56 
 
 		 1395 aa  712    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  100 
 
 		 1744 aa  3502    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  38.85 
 
 		 1393 aa  633  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  38.94 
 
 		 1439 aa  629  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  38.21 
 
 		 1439 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1376 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1495 aa  331  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1498 aa  322  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  26.93 
 
 		 1494 aa  320  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1498 aa  317  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1497 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1496 aa  300  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1473 aa  272  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1473 aa  271  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1262 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1481 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1593 aa  244  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1508 aa  234  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1481 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1608 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1631 aa  216  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1275 aa  204  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.91 
 
 		 1611 aa  192  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  26.66 
 
 		 1984 aa  188  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  25.15 
 
 		 1634 aa  184  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1990 aa  170  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  25.19 
 
 		 2580 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1847 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1640 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  28.18 
 
 		 971 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1489 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1690 aa  137  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1680 aa  132  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1625 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  45.12 
 
 		 1015 aa  110  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.18 
 
 		 1041 aa  105  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.88 
 
 		 1107 aa  102  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  28.85 
 
 		 448 aa  92.8  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  40.59 
 
 		 1266 aa  92  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.75 
 
 		 863 aa  91.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  35.22 
 
 		 307 aa  89.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  27.65 
 
 		 508 aa  89.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.63 
 
 		 1263 aa  88.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.63 
 
 		 1749 aa  87  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  37.5 
 
 		 416 aa  85.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.5 
 
 		 482 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  30.81 
 
 		 291 aa  84  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.2 
 
 		 892 aa  82.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.5 
 
 		 937 aa  82  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.5 
 
 		 937 aa  80.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  29.95 
 
 		 713 aa  80.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.52 
 
 		 354 aa  79.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.92 
 
 		 867 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.99 
 
 		 472 aa  77  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  27.6 
 
 		 296 aa  77.4  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.91 
 
 		 757 aa  74.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.41 
 
 		 886 aa  73.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  35.63 
 
 		 242 aa  72.8  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  27.23 
 
 		 574 aa  70.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  28.2 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.75 
 
 		 1024 aa  69.3  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  28.28 
 
 		 1335 aa  68.9  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  26.5 
 
 		 384 aa  68.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  32.69 
 
 		 1344 aa  67.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  34.42 
 
 		 347 aa  67.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  31.84 
 
 		 1780 aa  66.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  26.82 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.08 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  33.83 
 
 		 149 aa  65.9  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  42.99 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  27.47 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  27.2 
 
 		 565 aa  65.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  33.33 
 
 		 1112 aa  64.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  25.78 
 
 		 615 aa  65.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1052 aa  65.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  26.88 
 
 		 545 aa  64.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  36.27 
 
 		 761 aa  63.9  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  26.7 
 
 		 204 aa  63.9  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  27.2 
 
 		 583 aa  63.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  24.79 
 
 		 788 aa  63.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  23.97 
 
 		 788 aa  62.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  26.32 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.05 
 
 		 779 aa  62.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  27.91 
 
 		 765 aa  62.4  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1351 aa  62.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.05 
 
 		 765 aa  62.4  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  29.96 
 
 		 304 aa  61.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  28.34 
 
 		 772 aa  61.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  30.37 
 
 		 565 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  26.67 
 
 		 443 aa  62  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  25 
 
 		 766 aa  62  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.28 
 
 		 355 aa  61.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  24.62 
 
 		 772 aa  61.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  24.52 
 
 		 788 aa  60.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  29.38 
 
 		 2198 aa  61.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  26.8 
 
 		 432 aa  60.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.7 
 
 		 2132 aa  60.1  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  25.67 
 
 		 766 aa  60.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>