98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2212 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  34.96 
 
 		 1494 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  51.82 
 
 		 1508 aa  1360    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1481 aa  2954    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  94.33 
 
 		 1481 aa  2758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1395 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  28.56 
 
 		 1395 aa  403  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1495 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1393 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1439 aa  390  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1439 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1497 aa  365  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1498 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1376 aa  356  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1496 aa  354  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1498 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1459 aa  327  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1473 aa  313  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1473 aa  302  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1631 aa  298  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1608 aa  231  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  27.77 
 
 		 1611 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1262 aa  222  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1275 aa  220  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1744 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  27.81 
 
 		 1634 aa  207  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1847 aa  206  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  27.95 
 
 		 1984 aa  179  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1593 aa  178  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1990 aa  172  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1640 aa  162  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1489 aa  146  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1690 aa  142  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1625 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1680 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  23.77 
 
 		 2580 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  25.95 
 
 		 971 aa  115  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.47 
 
 		 1041 aa  76.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  26.84 
 
 		 583 aa  75.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.05 
 
 		 1263 aa  73.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  25.79 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.27 
 
 		 1344 aa  72.4  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  26.33 
 
 		 575 aa  72  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  36.3 
 
 		 1749 aa  71.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  25.92 
 
 		 565 aa  70.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.5 
 
 		 1107 aa  67.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 		 863 aa  67.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  34.19 
 
 		 867 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  22.81 
 
 		 713 aa  67  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  25.3 
 
 		 568 aa  66.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  23.95 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  32.5 
 
 		 307 aa  64.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.56 
 
 		 204 aa  64.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  38.41 
 
 		 354 aa  64.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.35 
 
 		 937 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  28.41 
 
 		 788 aa  63.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  31.85 
 
 		 291 aa  63.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.35 
 
 		 937 aa  62.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  28.12 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  26.04 
 
 		 545 aa  61.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  24.76 
 
 		 755 aa  61.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  24.76 
 
 		 731 aa  61.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  28.49 
 
 		 886 aa  61.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  27.45 
 
 		 1015 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  28.18 
 
 		 788 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  24.16 
 
 		 615 aa  61.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  24.76 
 
 		 755 aa  60.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.1 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.89 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  27.62 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  38.05 
 
 		 892 aa  57.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.33 
 
 		 296 aa  57.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  32.53 
 
 		 1024 aa  56.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  23.51 
 
 		 755 aa  56.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  34.91 
 
 		 448 aa  56.6  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.46 
 
 		 757 aa  55.5  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  25.94 
 
 		 622 aa  54.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52710  predicted protein  29.41 
 
 		 682 aa  53.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  24.35 
 
 		 443 aa  53.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.34 
 
 		 482 aa  52  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  24.47 
 
 		 547 aa  51.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  27.12 
 
 		 765 aa  51.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  26.67 
 
 		 2198 aa  51.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  29.03 
 
 		 972 aa  51.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  36.97 
 
 		 375 aa  50.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.37 
 
 		 2132 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.42 
 
 		 472 aa  49.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.98 
 
 		 476 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  34.38 
 
 		 2324 aa  48.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  31.34 
 
 		 1370 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  29.93 
 
 		 647 aa  48.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  31.43 
 
 		 347 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  35.92 
 
 		 293 aa  48.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  26.53 
 
 		 776 aa  47.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  31.3 
 
 		 490 aa  47.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 		 414 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  26.95 
 
 		 414 aa  46.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  29 
 
 		 1290 aa  46.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00740  hypothetical protein  30.97 
 
 		 670 aa  45.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.309758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>