101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2592 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  71.91 
 
 		 443 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  62.16 
 
 		 547 aa  680    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  64.13 
 
 		 583 aa  723    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  66.04 
 
 		 568 aa  713    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  100 
 
 		 603 aa  1232    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  62.56 
 
 		 575 aa  652    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  63.71 
 
 		 565 aa  699    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  63.62 
 
 		 574 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  63.98 
 
 		 545 aa  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  39.12 
 
 		 615 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  37.94 
 
 		 788 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  35.55 
 
 		 788 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  35.43 
 
 		 788 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  37.4 
 
 		 622 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  33.63 
 
 		 776 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  38.17 
 
 		 755 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  38.17 
 
 		 731 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  38.17 
 
 		 755 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  37.89 
 
 		 755 aa  333  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  36.17 
 
 		 765 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  38.25 
 
 		 301 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  34.15 
 
 		 388 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  34.15 
 
 		 318 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  37.5 
 
 		 581 aa  99.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  29.46 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  35 
 
 		 284 aa  94.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  30 
 
 		 763 aa  90.9  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  27.02 
 
 		 323 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1459 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1439 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  28.96 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  28.96 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1495 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1611 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1439 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1498 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1473 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1481 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  30.68 
 
 		 1497 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1494 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1473 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  31.11 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1376 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1498 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1496 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1395 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  29.01 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  23.66 
 
 		 1481 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1395 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  24.94 
 
 		 1634 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  36.76 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.75 
 
 		 713 aa  62  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1631 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.88 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.92 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1990 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  34.52 
 
 		 863 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  24.71 
 
 		 1984 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1640 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  32.12 
 
 		 1015 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.67 
 
 		 1344 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  29.05 
 
 		 539 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1508 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 		 475 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.62 
 
 		 937 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.62 
 
 		 937 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  27.15 
 
 		 508 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.46 
 
 		 867 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  32.11 
 
 		 447 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.61 
 
 		 892 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  30.7 
 
 		 1041 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  38.67 
 
 		 1393 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  28.9 
 
 		 384 aa  52  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1744 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.28 
 
 		 1263 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  33.07 
 
 		 528 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 441 aa  48.9  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 453 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 		 440 aa  48.5  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  22.08 
 
 		 1680 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  32.11 
 
 		 489 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 464 aa  47.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  25.79 
 
 		 355 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  26.96 
 
 		 523 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  29.32 
 
 		 761 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  25.79 
 
 		 350 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  41.77 
 
 		 476 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  33.9 
 
 		 296 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  24.23 
 
 		 1749 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  29.38 
 
 		 2491 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  30.49 
 
 		 414 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  32.67 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1565  hypothetical protein  28.07 
 
 		 453 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000172498 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.92 
 
 		 757 aa  45.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  22.59 
 
 		 1625 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.73 
 
 		 472 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  28.71 
 
 		 446 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>