109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2920 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 763 aa  1560    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  37.99 
 
 		 581 aa  191  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  30.68 
 
 		 1118 aa  160  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  38.7 
 
 		 776 aa  144  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  29.93 
 
 		 846 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  40.79 
 
 		 788 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  40.79 
 
 		 788 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  40.79 
 
 		 788 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1647  hypothetical protein  35.25 
 
 		 639 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.201062  normal  0.0771148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1394 aa  130  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  33.71 
 
 		 388 aa  109  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1575 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  39.89 
 
 		 583 aa  104  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  35.84 
 
 		 568 aa  93.6  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  36.69 
 
 		 1270 aa  90.9  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  30 
 
 		 603 aa  90.9  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  37.23 
 
 		 545 aa  87.8  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  36.02 
 
 		 547 aa  86.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  30.09 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  34.36 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  27.27 
 
 		 755 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  30.1 
 
 		 755 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  30.1 
 
 		 731 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  30.1 
 
 		 755 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  27.62 
 
 		 765 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  37.95 
 
 		 615 aa  80.9  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.36 
 
 		 1679 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  33.5 
 
 		 622 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  29.87 
 
 		 565 aa  77.8  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  27.54 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  26.49 
 
 		 535 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  29.06 
 
 		 301 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  33.87 
 
 		 318 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  27.78 
 
 		 575 aa  71.2  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  33.57 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  28.57 
 
 		 379 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  29.39 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  28.95 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  26.45 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  27.18 
 
 		 384 aa  66.6  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1389 aa  64.3  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  30.29 
 
 		 424 aa  63.9  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.14 
 
 		 863 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  27.64 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  31.79 
 
 		 528 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  29.85 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 437 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  37.93 
 
 		 443 aa  60.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.56 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.07 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 440 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 		 441 aa  57.4  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 437 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 437 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  28.12 
 
 		 440 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  27.6 
 
 		 1263 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  35.05 
 
 		 323 aa  55.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 450 aa  55.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  23.79 
 
 		 350 aa  54.3  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  27.02 
 
 		 523 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1059 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  29.59 
 
 		 499 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  31.94 
 
 		 631 aa  52.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  27.31 
 
 		 401 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  25.77 
 
 		 446 aa  52  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 412 aa  51.2  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  27.32 
 
 		 490 aa  51.2  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  25.89 
 
 		 531 aa  50.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 464 aa  50.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  25.7 
 
 		 447 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  24.47 
 
 		 439 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 414 aa  48.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  28.89 
 
 		 937 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  28.89 
 
 		 937 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  26.01 
 
 		 413 aa  48.1  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  25.41 
 
 		 447 aa  47.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  26.37 
 
 		 451 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 		 445 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 		 445 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 432 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 		 451 aa  47.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  27.61 
 
 		 452 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  28.81 
 
 		 414 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 		 460 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.69 
 
 		 713 aa  46.6  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 421 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 		 439 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2148  polysaccharide lyase polysaccharide lyase family 14 protein  30.97 
 
 		 356 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 		 3193 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 441 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  25 
 
 		 451 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  25.82 
 
 		 451 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 459 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  23.5 
 
 		 444 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  23.88 
 
 		 447 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  25.25 
 
 		 757 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  37.18 
 
 		 193 aa  45.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>