95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2243 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  100 
 
 		 846 aa  1742    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  29.93 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1394 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  29.24 
 
 		 1118 aa  99.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1647  hypothetical protein  28.89 
 
 		 639 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.201062  normal  0.0771148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3143  two component regulator propeller domain protein  30.97 
 
 		 361 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  26.6 
 
 		 692 aa  87.4  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  23.94 
 
 		 695 aa  87.4  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  27.21 
 
 		 1378 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1575 aa  71.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.22 
 
 		 1346 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  26.03 
 
 		 1054 aa  67  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  22.16 
 
 		 1008 aa  66.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  22.48 
 
 		 1366 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.75 
 
 		 1306 aa  64.3  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  25.77 
 
 		 1373 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 1453 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  24.82 
 
 		 1278 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  25.89 
 
 		 1316 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  25.16 
 
 		 1086 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  24.93 
 
 		 1370 aa  62.4  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.07 
 
 		 965 aa  61.2  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  25.12 
 
 		 1363 aa  61.2  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.21 
 
 		 1414 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 1226 aa  60.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.59 
 
 		 1355 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  22.97 
 
 		 985 aa  60.1  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  25.3 
 
 		 1397 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  22.28 
 
 		 1093 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  24.93 
 
 		 1335 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 1242 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  22.37 
 
 		 1374 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 1258 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  23.66 
 
 		 1378 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  24.2 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  25.9 
 
 		 1388 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  27.32 
 
 		 1334 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1272  hypothetical protein  27.49 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  22.99 
 
 		 1344 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 1211 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  24.53 
 
 		 1070 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  23.58 
 
 		 1278 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1270 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  26.97 
 
 		 1118 aa  55.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 1237 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  26.97 
 
 		 1114 aa  54.7  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0230  two-component sensor histidine kinase/response regulator  34.51 
 
 		 177 aa  54.7  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.949413  normal  0.193124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  24.44 
 
 		 1526 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  22.13 
 
 		 1034 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 1018 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  21.74 
 
 		 975 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  28.3 
 
 		 1373 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  36.62 
 
 		 1400 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  25 
 
 		 1404 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  23.89 
 
 		 1053 aa  52  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  26.15 
 
 		 1070 aa  51.2  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  23.81 
 
 		 1327 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  25.82 
 
 		 946 aa  51.2  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  23.03 
 
 		 990 aa  50.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  23.03 
 
 		 990 aa  50.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  27.87 
 
 		 1105 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1498 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  23.27 
 
 		 1407 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0403  two component regulator propeller domain protein  28.1 
 
 		 711 aa  48.5  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  24.07 
 
 		 1017 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 1349 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32.2 
 
 		 1347 aa  47.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3306  hypothetical protein  29.07 
 
 		 694 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0912335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  27.5 
 
 		 359 aa  47.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  24.71 
 
 		 1502 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  20.38 
 
 		 1418 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  22.77 
 
 		 1024 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  21.62 
 
 		 1384 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  22.37 
 
 		 1185 aa  47.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4115  two component regulator propeller domain-containing protein  25.11 
 
 		 357 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0684737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.71 
 
 		 1181 aa  46.2  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  25.93 
 
 		 1343 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  30.3 
 
 		 662 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  22.62 
 
 		 1340 aa  45.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  23.74 
 
 		 1051 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  23.76 
 
 		 1355 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  23.95 
 
 		 1324 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  24.29 
 
 		 1250 aa  45.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 		 1079 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  23.83 
 
 		 1191 aa  44.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.34 
 
 		 1524 aa  44.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.482461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  23.26 
 
 		 946 aa  44.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  29.19 
 
 		 954 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02697  sensory box protein  31.51 
 
 		 1510 aa  44.3  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  31.93 
 
 		 1374 aa  44.3  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.81 
 
 		 1030 aa  44.3  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  23.64 
 
 		 1342 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  22.63 
 
 		 1005 aa  44.3  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.8 
 
 		 1075 aa  44.3  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.71 
 
 		 1276 aa  44.3  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>