More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2442 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1030 aa  2110    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 1018 aa  835    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  32.24 
 
 		 1013 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  29.14 
 
 		 1009 aa  335  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  28.37 
 
 		 1017 aa  320  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 1453 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 1211 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  25.97 
 
 		 1024 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.16 
 
 		 965 aa  221  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  26.41 
 
 		 985 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  24.7 
 
 		 946 aa  210  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 1258 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  24.95 
 
 		 1105 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  26.08 
 
 		 1407 aa  194  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  25.97 
 
 		 976 aa  191  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  25.43 
 
 		 1008 aa  188  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.03 
 
 		 1346 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  22.29 
 
 		 975 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.28 
 
 		 1075 aa  179  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  22.02 
 
 		 1017 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  22.25 
 
 		 1363 aa  177  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  23.21 
 
 		 1306 aa  174  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  23.31 
 
 		 1374 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  25.44 
 
 		 1278 aa  172  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  23.05 
 
 		 1070 aa  165  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.38 
 
 		 1114 aa  160  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  23.28 
 
 		 1347 aa  159  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  23.25 
 
 		 1526 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  23.5 
 
 		 1313 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22 
 
 		 1070 aa  158  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.26 
 
 		 1397 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  22.54 
 
 		 1327 aa  152  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  20.63 
 
 		 1384 aa  151  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  22.84 
 
 		 1355 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.91 
 
 		 1498 aa  149  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  22.87 
 
 		 1093 aa  145  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  22.62 
 
 		 1334 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  21.19 
 
 		 1342 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  21.38 
 
 		 1054 aa  142  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  22.59 
 
 		 1370 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  20.56 
 
 		 1373 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  20.84 
 
 		 1316 aa  137  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  23.76 
 
 		 1418 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  23.01 
 
 		 967 aa  137  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  22.06 
 
 		 1388 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  23.68 
 
 		 1175 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  24.73 
 
 		 1004 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.19 
 
 		 1079 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  21.7 
 
 		 1366 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  25.21 
 
 		 1037 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  20.97 
 
 		 1063 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  22.24 
 
 		 1374 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  20.51 
 
 		 1400 aa  124  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  21.35 
 
 		 1118 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  21.3 
 
 		 1378 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  21.83 
 
 		 1053 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  20.43 
 
 		 1340 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  21 
 
 		 1278 aa  117  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  22.33 
 
 		 1378 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  22.31 
 
 		 1404 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  21.98 
 
 		 1355 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  22.95 
 
 		 954 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  26.27 
 
 		 1031 aa  116  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.69 
 
 		 1276 aa  116  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  21.33 
 
 		 1374 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  22.29 
 
 		 1335 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  20.78 
 
 		 1373 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  23.26 
 
 		 1396 aa  111  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  21.22 
 
 		 1093 aa  110  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  23.32 
 
 		 1194 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 742 aa  109  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  21.11 
 
 		 1324 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  19.59 
 
 		 1005 aa  107  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  22.21 
 
 		 1414 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  19.87 
 
 		 1084 aa  105  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  32.93 
 
 		 2361 aa  104  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  31.58 
 
 		 431 aa  104  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  20.12 
 
 		 1086 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  21.51 
 
 		 1347 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  26.71 
 
 		 1033 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 438 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 682 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  22.19 
 
 		 1046 aa  102  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  22.13 
 
 		 1036 aa  101  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  20.96 
 
 		 1034 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  22.05 
 
 		 1185 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  21.22 
 
 		 1344 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  29.53 
 
 		 413 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  26.35 
 
 		 1048 aa  99.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.11 
 
 		 1508 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 402 aa  99.4  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  22.77 
 
 		 1182 aa  98.6  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  20.21 
 
 		 1502 aa  98.2  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.29 
 
 		 1226 aa  98.2  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 564 aa  98.2  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  23.59 
 
 		 1515 aa  97.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  30.77 
 
 		 387 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 407 aa  97.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 401 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 652 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>