More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2339 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  100 
 
 		 1009 aa  2016    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  36.06 
 
 		 1013 aa  489  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  33.2 
 
 		 1017 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 1018 aa  355  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 1030 aa  353  8.999999999999999e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  26.67 
 
 		 1024 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 1211 aa  191  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  23.9 
 
 		 1075 aa  163  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.17 
 
 		 965 aa  157  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  24 
 
 		 1370 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.92 
 
 		 1397 aa  154  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  24.56 
 
 		 985 aa  141  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 1258 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  21.44 
 
 		 1070 aa  140  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  24.63 
 
 		 1278 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  21.33 
 
 		 1355 aa  137  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  24.53 
 
 		 976 aa  136  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  21.16 
 
 		 975 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  28.05 
 
 		 954 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 1453 aa  131  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  21.74 
 
 		 1070 aa  131  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  28.02 
 
 		 1031 aa  131  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  28.4 
 
 		 1017 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  24.49 
 
 		 1037 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.85 
 
 		 1346 aa  119  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  21.61 
 
 		 1374 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  25 
 
 		 1004 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  36.62 
 
 		 422 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  23.38 
 
 		 1008 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  21.41 
 
 		 1053 aa  113  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  28.73 
 
 		 1048 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.19 
 
 		 1114 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  22.38 
 
 		 946 aa  112  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  35.85 
 
 		 431 aa  112  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  34.67 
 
 		 430 aa  111  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 652 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  21.17 
 
 		 1278 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  28.31 
 
 		 1175 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  20.47 
 
 		 1373 aa  108  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  37.37 
 
 		 2361 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  24.46 
 
 		 1063 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  25.06 
 
 		 1526 aa  107  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.91 
 
 		 1079 aa  107  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 412 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  19.84 
 
 		 1363 aa  105  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  34.18 
 
 		 412 aa  105  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  25.06 
 
 		 1250 aa  105  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  23.25 
 
 		 1327 aa  105  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  27.17 
 
 		 1418 aa  105  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  21.14 
 
 		 1347 aa  104  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 438 aa  104  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  21.32 
 
 		 1335 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 468 aa  104  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  35.03 
 
 		 409 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.1 
 
 		 387 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  28 
 
 		 1033 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  25 
 
 		 967 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  22.66 
 
 		 1093 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 508 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  37.44 
 
 		 362 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  20.42 
 
 		 1054 aa  99.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  22.12 
 
 		 1407 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 381 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  22.68 
 
 		 1313 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  18.9 
 
 		 1400 aa  99  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  22.66 
 
 		 1324 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 		 1093 aa  98.6  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  21.96 
 
 		 1334 aa  98.6  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  21.91 
 
 		 1388 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  30.77 
 
 		 1105 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  22.93 
 
 		 1404 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  31.89 
 
 		 413 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  24.14 
 
 		 1384 aa  95.9  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  24.03 
 
 		 1036 aa  95.9  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  30.35 
 
 		 1311 aa  95.1  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.37 
 
 		 1226 aa  94.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 742 aa  94.4  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 391 aa  94  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 344 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  25.57 
 
 		 1374 aa  92.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  34.83 
 
 		 671 aa  91.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1105  signal transduction histidine kinase-like protein  23.48 
 
 		 1141 aa  91.3  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  36.59 
 
 		 397 aa  91.3  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  33.67 
 
 		 338 aa  91.3  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  18.6 
 
 		 1373 aa  90.9  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 372 aa  90.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  19.57 
 
 		 1034 aa  90.1  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 351 aa  89.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 351 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  21.92 
 
 		 1051 aa  90.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 411 aa  90.1  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 402 aa  89.7  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 351 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  36.36 
 
 		 363 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 351 aa  89.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 351 aa  89.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  20.45 
 
 		 1342 aa  89.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.88 
 
 		 1276 aa  89  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  25.07 
 
 		 1185 aa  89  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 517 aa  88.6  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>