More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0276 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  100 
 
 		 387 aa  773    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  53.49 
 
 		 431 aa  363  4e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  49.34 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.75 
 
 		 468 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  45.8 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.64 
 
 		 412 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  47.96 
 
 		 422 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.48 
 
 		 508 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  44.01 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  50.98 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  39.01 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  42.97 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  43.14 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  37.46 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  37.24 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 411 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  43.4 
 
 		 2361 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  35.8 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 652 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  36.99 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  35.61 
 
 		 1031 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  36.19 
 
 		 1033 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  45.54 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  34.56 
 
 		 1048 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 742 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  43.84 
 
 		 448 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  30.13 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 352 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  36.9 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0512  histidine kinase  46.94 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 546 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  33.33 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  32.03 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 517 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 574 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  37.07 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  37.62 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  27.49 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 438 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 458 aa  112  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 359 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 682 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  31.35 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  30.98 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  34.3 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  28.08 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  38.46 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 501 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 610 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 581 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4713  histidine kinase  38.01 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.739692 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 661 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  38.5 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  40.31 
 
 		 717 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 526 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 467 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  27.33 
 
 		 451 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 469 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  33.86 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4861  histidine kinase  39.09 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.164786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 640 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  27.27 
 
 		 693 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  29.36 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  35.05 
 
 		 1013 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  24.2 
 
 		 592 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 564 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  29.39 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  24.5 
 
 		 595 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 440 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  35.1 
 
 		 1009 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 463 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 1168 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  36.04 
 
 		 772 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 770 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  30.58 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  26.48 
 
 		 597 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 573 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  31.34 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 775 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  30.6 
 
 		 456 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 456 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>