More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2736 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  100 
 
 		 430 aa  852    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  58.43 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  50.24 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  49.75 
 
 		 406 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  43.02 
 
 		 443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  44.26 
 
 		 449 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  36 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  37.43 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.05 
 
 		 399 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  48.57 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  36.16 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  47.03 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 441 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  44.89 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  43.98 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  42.8 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  35.5 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  34.94 
 
 		 447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.64 
 
 		 433 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  32.91 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  34.51 
 
 		 417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  33.09 
 
 		 384 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  36.04 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.8 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  44.95 
 
 		 395 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.52 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  40.77 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  34.6 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  43.57 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  40.79 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 424 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  37.75 
 
 		 399 aa  156  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  50.5 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.41 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  45.93 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  34.99 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  45.76 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7416  histidine kinase  37.6 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  49.53 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  41.2 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 445 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  44.83 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.86 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.24 
 
 		 357 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.36 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  43.27 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  37.45 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.74 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 441 aa  143  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  33.08 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.54 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.04 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.55 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  42.57 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  46.19 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.33 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  39.15 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  33.52 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  33.33 
 
 		 434 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  39.69 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  44.93 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.96 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  35.95 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  46.8 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.24 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33000  signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 411 aa  136  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  43.48 
 
 		 457 aa  136  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  40.08 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.06 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.77 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.99 
 
 		 271 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  40.17 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.09 
 
 		 370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.69 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  43.2 
 
 		 369 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  40.68 
 
 		 372 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 389 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  41.28 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.64 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  41.67 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0240  histidine kinase  39.22 
 
 		 370 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.66 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>