More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5201 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 393 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  58.09 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.29 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 		 373 aa  332  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 665 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  32.91 
 
 		 596 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 564 aa  142  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 574 aa  142  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 591 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 591 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 725 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  37.29 
 
 		 529 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 523 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 552 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 682 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 682 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  33.74 
 
 		 523 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  33.33 
 
 		 523 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  32.22 
 
 		 523 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  33.74 
 
 		 523 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 516 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 523 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  33.74 
 
 		 523 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 544 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  36.87 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  36.87 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  36.2 
 
 		 351 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  36.2 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  36.65 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 775 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  37.4 
 
 		 573 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 584 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 582 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 552 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 365 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 365 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 566 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  32.86 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  29.66 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  28.9 
 
 		 370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  32.58 
 
 		 552 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 573 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  36.97 
 
 		 572 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 567 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 566 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 566 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 566 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 779 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  29.25 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 550 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 580 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  37.74 
 
 		 710 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  37.74 
 
 		 710 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  42.05 
 
 		 577 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 412 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 472 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  35.32 
 
 		 830 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  39.51 
 
 		 282 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 655 aa  106  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 595 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>