More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0512 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0512  histidine kinase  100 
 
 		 339 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  46.67 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  43.48 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 451 aa  159  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.96 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  40.16 
 
 		 389 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 508 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  44.76 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  45.18 
 
 		 430 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  37.5 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.21 
 
 		 412 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  35.96 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  40.64 
 
 		 407 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  42.51 
 
 		 2361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 		 468 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  41.55 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  44.06 
 
 		 431 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  31.92 
 
 		 597 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  40.72 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  47.02 
 
 		 433 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  40.95 
 
 		 412 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  43.4 
 
 		 432 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  38.14 
 
 		 402 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  44.9 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  36.91 
 
 		 433 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  33.54 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 414 aa  90.1  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  35.64 
 
 		 388 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 725 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 421 aa  89.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  38.14 
 
 		 1033 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.31 
 
 		 393 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  38.74 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  23.93 
 
 		 595 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  23.87 
 
 		 595 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  34.26 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 546 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 595 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  36.36 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  30.34 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  33.08 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 581 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  32.12 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  37.07 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  29.73 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  35.68 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  32.66 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  38.14 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  31.31 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  23.79 
 
 		 592 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  31.66 
 
 		 523 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  35.62 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  32.87 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  38.1 
 
 		 717 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 564 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  39.34 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  32.66 
 
 		 523 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 523 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  39.23 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 775 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  33.65 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.49 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5264  two-component sensor protein, C-terminus  33.71 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  31.4 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  37.19 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>