More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5078 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  100 
 
 		 368 aa  702    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  65.41 
 
 		 338 aa  349  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  60.06 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  54.4 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.05 
 
 		 333 aa  282  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.49 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.49 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0589  putative signal transduction histidine kinase  55.49 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1647  histidine kinase  51.63 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  43.32 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  33.67 
 
 		 497 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 541 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.84 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 541 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  39.05 
 
 		 482 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  38.12 
 
 		 687 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  41.36 
 
 		 619 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  41.36 
 
 		 680 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  41.36 
 
 		 680 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  38.53 
 
 		 598 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 692 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.82 
 
 		 1226 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  41.83 
 
 		 797 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 594 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0719701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  41.62 
 
 		 501 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 598 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  39.32 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 1101 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  37.81 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  32.83 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 1168 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 1168 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  40.87 
 
 		 799 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 682 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 595 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.27 
 
 		 466 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 596 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 700 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  33 
 
 		 456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.28 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 1229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 795 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  34.68 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  31.88 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  34.68 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  35.48 
 
 		 298 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 771 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.64 
 
 		 683 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 799 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  35.82 
 
 		 296 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  35.82 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 552 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  32.52 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  38.68 
 
 		 671 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  29.82 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  38.61 
 
 		 795 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 553 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  36.2 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  29.82 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  34.27 
 
 		 459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 665 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  34.31 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  38.69 
 
 		 783 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  38.12 
 
 		 594 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 795 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  35.81 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 447 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 795 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 509 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  32.19 
 
 		 447 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 662 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  32.35 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 671 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 561 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 658 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  37.5 
 
 		 662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  37.79 
 
 		 492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  37.79 
 
 		 492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 703 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>