More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2171 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.1 
 
 
594 aa  1011    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  100 
 
 
594 aa  1139    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.44 
 
 
594 aa  1028    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
363 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
489 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
671 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
384 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
801 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 
665 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
395 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 
596 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 
594 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  42.86 
 
 
598 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  40.42 
 
 
619 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  40.42 
 
 
680 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  41.02 
 
 
383 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
595 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  40 
 
 
680 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
598 aa  144  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  41.36 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  39.82 
 
 
797 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  40.27 
 
 
799 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  40.8 
 
 
740 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
795 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  39.66 
 
 
687 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  38.91 
 
 
575 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  38.91 
 
 
575 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  23.82 
 
 
1335 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  38.91 
 
 
575 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
363 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
366 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
370 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  31.19 
 
 
482 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
795 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  38.94 
 
 
458 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
795 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
795 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
450 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
703 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
448 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
799 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
420 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
373 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  36.56 
 
 
489 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  38.33 
 
 
683 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
700 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
700 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
1168 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
684 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
707 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
385 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
490 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
359 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  36.99 
 
 
461 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
553 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
703 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  38.36 
 
 
671 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
526 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
748 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
384 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
334 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
468 aa  127  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  36.91 
 
 
447 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  36.71 
 
 
373 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
447 aa  126  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  34.85 
 
 
368 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
521 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  33.14 
 
 
356 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
492 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  38.14 
 
 
670 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
381 aa  123  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  40.37 
 
 
1809 aa  123  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
490 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  37.73 
 
 
481 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
700 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  35.62 
 
 
381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  35.62 
 
 
381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  36.89 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
997 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  38.89 
 
 
492 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  35.96 
 
 
582 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  38.89 
 
 
463 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  38.89 
 
 
492 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  38.89 
 
 
463 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
582 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  38.89 
 
 
492 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
1229 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  38.89 
 
 
492 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>