More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3391 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  100 
 
 
356 aa  683    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  73.23 
 
 
338 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.13 
 
 
326 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.13 
 
 
326 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0589  putative signal transduction histidine kinase  64.13 
 
 
365 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  60.06 
 
 
368 aa  334  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1647  histidine kinase  58.63 
 
 
308 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  57.86 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.29 
 
 
333 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  44.95 
 
 
343 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 
334 aa  216  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  35.02 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  35.02 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
381 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 
541 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.01 
 
 
466 aa  142  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  38.81 
 
 
456 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  33.33 
 
 
497 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  37.82 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  35.25 
 
 
619 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  34.27 
 
 
687 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  35.25 
 
 
680 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
541 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  31.64 
 
 
482 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
594 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  34.57 
 
 
680 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.92 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  33.76 
 
 
388 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
703 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.81 
 
 
489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  38.86 
 
 
377 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
490 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  37.71 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  35.55 
 
 
515 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
684 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
671 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
707 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  38.89 
 
 
671 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
703 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
700 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  39.55 
 
 
640 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
700 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
598 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
700 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
553 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
359 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
370 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
485 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  37.88 
 
 
1101 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
665 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  39.07 
 
 
670 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  36.14 
 
 
451 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
384 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
385 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
799 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  37.62 
 
 
598 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
596 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
1168 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  38.49 
 
 
404 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
1229 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4713  histidine kinase  38.49 
 
 
404 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.739692 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  35.14 
 
 
357 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
595 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
439 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
357 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  35.19 
 
 
485 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.95 
 
 
373 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  35.65 
 
 
493 aa  122  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  32.18 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  36.68 
 
 
1226 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  36.3 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  34.55 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
795 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
395 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  39.9 
 
 
799 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
662 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  38.83 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
682 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  38.53 
 
 
501 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  31.58 
 
 
594 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
421 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  37.45 
 
 
662 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
480 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  38.16 
 
 
461 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
748 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
509 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
795 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  35.51 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  35.51 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  35.51 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  35.51 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  35.51 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
795 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  39.42 
 
 
797 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  35.51 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
692 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
381 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>