More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0301 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
748 aa  1522    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  36.71 
 
 
357 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  37.15 
 
 
357 aa  221  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  46.06 
 
 
381 aa  220  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  46.06 
 
 
381 aa  220  6e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
381 aa  221  6e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
357 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
989 aa  214  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
363 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  33.06 
 
 
515 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
1226 aa  180  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  30.56 
 
 
1101 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
1229 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
370 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
462 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  32.81 
 
 
717 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
462 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
450 aa  172  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
384 aa  172  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
490 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  32.28 
 
 
492 aa  171  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  32.28 
 
 
492 aa  171  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
492 aa  171  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  32.28 
 
 
492 aa  171  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  32.28 
 
 
492 aa  171  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  32.28 
 
 
463 aa  170  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  32.28 
 
 
463 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  33.51 
 
 
458 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
658 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  33.77 
 
 
410 aa  164  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
748 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
526 aa  163  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  31.5 
 
 
463 aa  163  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
665 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
448 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
378 aa  161  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164628  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
662 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
366 aa  160  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
671 aa  160  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  41.23 
 
 
662 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
703 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
553 aa  157  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3077  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
378 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
541 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
598 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
684 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.62 
 
 
640 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
707 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
594 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  38.21 
 
 
598 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
703 aa  154  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
489 aa  154  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  35.31 
 
 
680 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  35.09 
 
 
680 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  35.09 
 
 
619 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  35.93 
 
 
388 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  34.6 
 
 
687 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  32.21 
 
 
485 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
595 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  40.27 
 
 
489 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  30.53 
 
 
383 aa  151  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
700 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  29.59 
 
 
683 aa  150  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
596 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
700 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
700 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
573 aa  147  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
546 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  38.68 
 
 
497 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  37.62 
 
 
482 aa  147  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  37.7 
 
 
575 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4650  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
466 aa  147  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3574  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
466 aa  147  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382428 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  30.92 
 
 
1809 aa  147  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
535 aa  147  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  37.3 
 
 
575 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  37.3 
 
 
575 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
521 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
412 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  36.97 
 
 
392 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
779 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  37.25 
 
 
740 aa  144  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
541 aa  144  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  36.32 
 
 
391 aa  144  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
490 aa  143  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  37.44 
 
 
393 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
1168 aa  142  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
401 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
401 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  31.48 
 
 
710 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  31.48 
 
 
710 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
799 aa  140  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  31.49 
 
 
525 aa  140  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
644 aa  140  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  30.42 
 
 
795 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
401 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
795 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
2153 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
771 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>