More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1204 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
779 aa  1576    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
662 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
658 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  42.92 
 
 
662 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  43.44 
 
 
482 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  39.18 
 
 
640 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
490 aa  171  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  42.6 
 
 
388 aa  168  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  37.7 
 
 
497 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  41.12 
 
 
391 aa  153  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  36.48 
 
 
392 aa  151  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
725 aa  147  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  37.65 
 
 
381 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
381 aa  144  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
748 aa  144  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
381 aa  144  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
381 aa  144  7e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  35.68 
 
 
379 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
640 aa  141  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
545 aa  138  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.57 
 
 
489 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  39.62 
 
 
357 aa  137  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  39.37 
 
 
357 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
357 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
391 aa  134  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
544 aa  131  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  36 
 
 
338 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
548 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  38.4 
 
 
393 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  35.94 
 
 
391 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
372 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
545 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  29.04 
 
 
372 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
359 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  29.93 
 
 
372 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  34.31 
 
 
347 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  33.49 
 
 
357 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  33.95 
 
 
358 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
372 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
372 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
365 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
372 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
521 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
591 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
399 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
484 aa  126  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.55 
 
 
1226 aa  126  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  38.49 
 
 
395 aa  126  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
700 aa  126  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
591 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  30.07 
 
 
596 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
584 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  29.18 
 
 
372 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  35 
 
 
1101 aa  125  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  34.62 
 
 
353 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  33.03 
 
 
393 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
1229 aa  124  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
381 aa  124  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
695 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
493 aa  124  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  36.99 
 
 
396 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
464 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.9 
 
 
1739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  28.97 
 
 
365 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
552 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
376 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
456 aa  121  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  30.87 
 
 
515 aa  120  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  35.32 
 
 
394 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
535 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.31 
 
 
456 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
644 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
771 aa  119  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  33.01 
 
 
783 aa  119  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
401 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  30.28 
 
 
395 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
401 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
770 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  35.11 
 
 
325 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  30 
 
 
344 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  30 
 
 
344 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  32.23 
 
 
337 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  34.39 
 
 
249 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
475 aa  117  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1982  sensor histidine kinase, putative  30.24 
 
 
344 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  35.68 
 
 
394 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
376 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  33.03 
 
 
687 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  32.21 
 
 
456 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
703 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  32.75 
 
 
710 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  32.75 
 
 
710 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  32.68 
 
 
598 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
450 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  33.64 
 
 
404 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  34.26 
 
 
349 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>