More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1913 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  100 
 
 		 353 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  59.88 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  62.17 
 
 		 358 aa  411  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  56.6 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  37.36 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  36.49 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  33.8 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  34.67 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  33.24 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  31.94 
 
 		 396 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  33.69 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  31.9 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  31.67 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  30.22 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  30.95 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  35.02 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  36.7 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  28.88 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  26.67 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 748 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  34.67 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 658 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  36.07 
 
 		 640 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 591 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 662 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 779 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  35.35 
 
 		 662 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.26 
 
 		 489 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  33.8 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 591 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  35.19 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 771 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  31.16 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  33.65 
 
 		 518 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4182  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 381 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  33.49 
 
 		 596 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 381 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  33.01 
 
 		 772 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 461 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  34.74 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.55 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  30.99 
 
 		 585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  31.16 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  30.7 
 
 		 497 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 775 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  30.7 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  34.72 
 
 		 470 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 471 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 650 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3782  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 459 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 584 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 469 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 770 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 394 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 545 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.58 
 
 		 683 aa  109  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  30.04 
 
 		 515 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 640 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0800  histidine kinase  27.97 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 574 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 700 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 552 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  25.74 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 544 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  30.09 
 
 		 402 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  28.91 
 
 		 223 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 466 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  34.88 
 
 		 466 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 599 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  29.72 
 
 		 783 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 545 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>