More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0789 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  72.81 
 
 		 460 aa  680    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  70.11 
 
 		 466 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  69.89 
 
 		 466 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  70.32 
 
 		 466 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.03 
 
 		 461 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  71.43 
 
 		 470 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.41 
 
 		 471 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.46 
 
 		 459 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.03 
 
 		 459 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.39 
 
 		 471 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  70.11 
 
 		 466 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  70.11 
 
 		 466 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 469 aa  944    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.03 
 
 		 480 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.46 
 
 		 459 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.03 
 
 		 480 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  70.32 
 
 		 466 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  70.11 
 
 		 466 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.59 
 
 		 486 aa  705    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  53.83 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  51.38 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.72 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.43 
 
 		 488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  53.22 
 
 		 488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  52.45 
 
 		 487 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  49.35 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.81 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 		 477 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  46.37 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  47.15 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  43.47 
 
 		 470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  44.14 
 
 		 467 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  39.78 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  39.83 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  35.93 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  39.46 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 474 aa  302  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 480 aa  296  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  39.77 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  39.29 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 467 aa  279  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  40.93 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  38.17 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 564 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  40.36 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 695 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  31.74 
 
 		 564 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  39.15 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  35.16 
 
 		 557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  35.47 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  34.38 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.65 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.68 
 
 		 640 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 535 aa  126  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 521 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  33.94 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  35.6 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 1229 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 357 aa  123  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  35.78 
 
 		 249 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 1101 aa  121  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 585 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  33.91 
 
 		 1226 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  32.11 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 771 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  36 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  34.29 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  39.73 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  34.73 
 
 		 671 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 563 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  32.33 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  32.61 
 
 		 525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  31.47 
 
 		 357 aa  118  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 725 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.83 
 
 		 584 aa  118  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.859036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 770 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  35.93 
 
 		 799 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.76 
 
 		 373 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  31.4 
 
 		 391 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 401 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  27.21 
 
 		 553 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 401 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 700 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 401 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  35.65 
 
 		 797 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  30.63 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 381 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  35.68 
 
 		 772 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>