More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3079 on replicon NC_013207
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  100 
 
 
223 aa  458  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  36.75 
 
 
392 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  37.22 
 
 
388 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  35.11 
 
 
379 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
548 aa  146  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  36.7 
 
 
393 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  40.2 
 
 
381 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  32.68 
 
 
391 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  34.42 
 
 
391 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
748 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
584 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
545 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
591 aa  131  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  36.27 
 
 
497 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  33.66 
 
 
395 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
448 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
591 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  35.2 
 
 
395 aa  128  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
469 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
564 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  37.5 
 
 
489 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
463 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  37.44 
 
 
393 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
544 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
450 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  32.37 
 
 
462 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
700 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  33.18 
 
 
596 aa  121  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
545 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  32.88 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  34.3 
 
 
458 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  31.96 
 
 
384 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
771 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
399 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
595 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
665 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
412 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  33.63 
 
 
451 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  32.58 
 
 
338 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
596 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
594 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  31.68 
 
 
740 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  31.67 
 
 
366 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
598 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
357 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  31.22 
 
 
529 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  32.18 
 
 
575 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  32.18 
 
 
575 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
658 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  33.66 
 
 
347 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  30 
 
 
347 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  33.66 
 
 
640 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  34.48 
 
 
598 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
381 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  33.03 
 
 
1101 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.11 
 
 
515 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  31.68 
 
 
575 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  33.49 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
1229 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
682 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  32.55 
 
 
357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
490 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  34.78 
 
 
645 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  33.33 
 
 
482 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
546 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34 
 
 
383 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  35.98 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
381 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  33.97 
 
 
662 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  31.02 
 
 
344 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
662 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
700 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  33.03 
 
 
1226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
700 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  31.02 
 
 
344 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  33.65 
 
 
381 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  33.65 
 
 
381 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
403 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
700 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
552 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
468 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
725 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
541 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0181  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
388 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  31.53 
 
 
349 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  29.68 
 
 
357 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  31.65 
 
 
249 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
541 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
574 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
464 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
386 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
391 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  32.99 
 
 
1809 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  34.78 
 
 
381 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
703 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  34.31 
 
 
447 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
552 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 
485 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
403 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
682 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>