More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4714 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  100 
 
 
447 aa  910    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  52.57 
 
 
383 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
650 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
535 aa  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
784 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
561 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
469 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
471 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 
471 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1869  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
553 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  32.18 
 
 
357 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  39.73 
 
 
466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  39.73 
 
 
466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  39.73 
 
 
466 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  39.73 
 
 
466 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
480 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  39.73 
 
 
466 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
480 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  31.9 
 
 
357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  39.73 
 
 
466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  39.19 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
357 aa  140  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
461 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  39.29 
 
 
466 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
459 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
459 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  39.73 
 
 
470 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  37.21 
 
 
387 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
475 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  38.36 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  38.25 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  35.71 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  38.1 
 
 
392 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
462 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
462 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  39.27 
 
 
456 aa  126  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  37.84 
 
 
683 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  27.16 
 
 
501 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  28.01 
 
 
585 aa  123  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
748 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
488 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  34.67 
 
 
575 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  35.11 
 
 
575 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  34.67 
 
 
575 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  31.75 
 
 
488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  30.3 
 
 
525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
461 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  33.91 
 
 
1739 aa  119  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  35.78 
 
 
287 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  36.04 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.16 
 
 
515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
573 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  39.02 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  36.97 
 
 
458 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  34.22 
 
 
463 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  32.93 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  37.39 
 
 
456 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  35.21 
 
 
388 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
464 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  29.82 
 
 
344 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  29.82 
 
 
344 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  35.1 
 
 
391 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  33.04 
 
 
740 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  33.62 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  33.78 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
644 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  33.78 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  33.78 
 
 
492 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  33.78 
 
 
492 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  33.78 
 
 
492 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  27.42 
 
 
495 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
492 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  33.78 
 
 
492 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  33.72 
 
 
632 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.18 
 
 
487 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
384 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  37.05 
 
 
323 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  34.51 
 
 
394 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  35.05 
 
 
1226 aa  113  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  33.04 
 
 
497 aa  113  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
339 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  31.65 
 
 
783 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  33.64 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  33.2 
 
 
526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  37.8 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
695 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  36.15 
 
 
1046 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
700 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>