More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1869 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1869  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 553 aa  1127    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 394 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 535 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.35 
 
 		 650 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 561 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 447 aa  161  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  40.64 
 
 		 387 aa  158  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 658 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  35.6 
 
 		 575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  37.84 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  35.2 
 
 		 575 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  35.2 
 
 		 575 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.99 
 
 		 630 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 662 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  35.71 
 
 		 662 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 585 aa  146  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  34.78 
 
 		 640 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  34.47 
 
 		 740 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 594 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.49 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  30.33 
 
 		 830 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  32.64 
 
 		 391 aa  140  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  35.19 
 
 		 482 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 596 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 595 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 598 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  35.04 
 
 		 515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  35.04 
 
 		 598 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 640 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  40.27 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 410 aa  134  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 748 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  34.09 
 
 		 391 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.13 
 
 		 489 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  35.1 
 
 		 645 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 359 aa  133  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  37.61 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  33.9 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 700 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  37.61 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 700 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 700 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.37 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  33.08 
 
 		 388 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 703 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 700 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 381 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 468 aa  130  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 684 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.1 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 703 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 707 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  33.61 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  32.8 
 
 		 497 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 373 aa  128  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  37.02 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  33.8 
 
 		 664 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 475 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  32.26 
 
 		 687 aa  127  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.85 
 
 		 1808 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 490 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 478 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  32.02 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  32.31 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.78 
 
 		 300 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 695 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  33.63 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 357 aa  125  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 479 aa  125  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 700 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 779 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4152  histidine kinase  43.75 
 
 		 662 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  33.33 
 
 		 353 aa  124  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  32.62 
 
 		 1739 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.03 
 
 		 647 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  30.98 
 
 		 461 aa  123  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.86 
 
 		 373 aa  123  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.59 
 
 		 373 aa  123  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 1046 aa  123  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  32.61 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  32.61 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  31.97 
 
 		 619 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  32.61 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  32.61 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 546 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  32.61 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>