More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4152 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4152  histidine kinase  100 
 
 
662 aa  1351    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0264  Signal transduction histidine kinase-like  48.71 
 
 
666 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01273  putative two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid  44.35 
 
 
702 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1182 aa  281  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
1550 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  38.12 
 
 
823 aa  254  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1611 aa  253  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 
874 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1075 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1452 aa  248  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  36.24 
 
 
982 aa  247  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
957 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
1363 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.59 
 
 
631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
939 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
767 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  32.02 
 
 
1177 aa  242  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6238  histidine kinase  34.03 
 
 
519 aa  242  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547868  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1398 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
1127 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
921 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1691 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.11 
 
 
982 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  32.27 
 
 
667 aa  238  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  31.67 
 
 
761 aa  238  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  34.95 
 
 
803 aa  237  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0125  Histidine kinase  36.18 
 
 
615 aa  238  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 
989 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
989 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1333 aa  236  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
816 aa  236  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  37.06 
 
 
1040 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
969 aa  236  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 
950 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  35.84 
 
 
882 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 
925 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
1125 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
947 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
1275 aa  234  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.35 
 
 
923 aa  234  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1011 aa  234  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  31.08 
 
 
680 aa  233  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
524 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.45 
 
 
1763 aa  233  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1202 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
1622 aa  233  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  37.22 
 
 
1125 aa  233  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
674 aa  233  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1135 aa  233  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1266 aa  233  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.34 
 
 
858 aa  232  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  31.15 
 
 
544 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
1287 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  30.47 
 
 
528 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1313 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1326 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.36 
 
 
1331 aa  231  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
1165 aa  231  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1222 aa  231  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  30.49 
 
 
598 aa  231  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  35.1 
 
 
606 aa  230  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 
969 aa  230  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
784 aa  229  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
1350 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
1240 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  36.62 
 
 
497 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.59 
 
 
1442 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
1582 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  35.92 
 
 
758 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
846 aa  228  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
778 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1002 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1002 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  35.48 
 
 
732 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1267 aa  227  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
823 aa  226  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
1788 aa  226  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30.52 
 
 
1135 aa  226  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  35.16 
 
 
578 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
738 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
721 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
957 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
750 aa  225  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
827 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
1255 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
995 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
780 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
862 aa  224  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
878 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
947 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  34.87 
 
 
810 aa  224  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
791 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  32.79 
 
 
945 aa  224  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  37.22 
 
 
853 aa  223  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
770 aa  223  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  36.84 
 
 
1121 aa  223  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.33 
 
 
1499 aa  223  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
803 aa  223  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
977 aa  223  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  34.79 
 
 
1191 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>