More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1697 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  100 
 
 		 664 aa  1369    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  35.53 
 
 		 659 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  35.49 
 
 		 638 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  36.57 
 
 		 653 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  32.04 
 
 		 670 aa  313  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  40.79 
 
 		 738 aa  220  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  38.35 
 
 		 643 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  39.86 
 
 		 645 aa  209  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  29.45 
 
 		 645 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  35.63 
 
 		 687 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  32.52 
 
 		 592 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  27.95 
 
 		 606 aa  144  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  32.71 
 
 		 287 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  30.12 
 
 		 270 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  29.27 
 
 		 616 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  34.34 
 
 		 246 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  33.17 
 
 		 632 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 490 aa  118  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 730 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  30.33 
 
 		 585 aa  117  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  32.1 
 
 		 475 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 471 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  34.4 
 
 		 363 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  31.4 
 
 		 525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  31.95 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  34.36 
 
 		 456 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  30.71 
 
 		 461 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 486 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  28.79 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 469 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  30.34 
 
 		 451 aa  112  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  27.64 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  27.99 
 
 		 600 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.51 
 
 		 489 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 471 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1869  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  29.23 
 
 		 526 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5408  histidine kinase  34.6 
 
 		 494 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0406252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  25.85 
 
 		 668 aa  107  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 461 aa  107  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  29.09 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  32.94 
 
 		 1024 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  28.94 
 
 		 278 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  31.58 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  23.96 
 
 		 657 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  28.84 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 461 aa  106  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 480 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 480 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  30.23 
 
 		 325 aa  105  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  33.03 
 
 		 349 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 603 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  34.42 
 
 		 518 aa  104  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  30.49 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 535 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  28.25 
 
 		 337 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 459 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 481 aa  103  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 658 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  31.03 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4665  histidine kinase  25.85 
 
 		 306 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  30.33 
 
 		 464 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 475 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  34.65 
 
 		 467 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  30.63 
 
 		 470 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  32.04 
 
 		 830 aa  101  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 478 aa  101  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 339 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  35.35 
 
 		 223 aa  100  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 662 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  30.96 
 
 		 313 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 459 aa  100  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 408 aa  99.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 700 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 381 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1557  putative signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 273 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 381 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 640 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  29.2 
 
 		 662 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.23 
 
 		 482 aa  99  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 1168 aa  98.6  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1560  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 569 aa  98.2  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  25.66 
 
 		 1739 aa  98.2  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  24.75 
 
 		 1063 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 1101 aa  97.8  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 1229 aa  98.2  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 468 aa  98.2  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>