More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3793 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  98.93 
 
 		 373 aa  736    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 373 aa  743    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  71.71 
 
 		 372 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  67.9 
 
 		 385 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  66.2 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  59.23 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.28 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  48.25 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.27 
 
 		 373 aa  166  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  39.38 
 
 		 799 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  38.94 
 
 		 797 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  37.18 
 
 		 493 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 799 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 795 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 801 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 553 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 795 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 795 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 1168 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  37.45 
 
 		 795 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 665 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 541 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  37.83 
 
 		 740 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 546 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 541 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  34.33 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  37.28 
 
 		 575 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  37.28 
 
 		 575 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  37.28 
 
 		 575 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 671 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 700 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 684 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 707 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  35.32 
 
 		 671 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 		 492 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 492 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  36.07 
 
 		 492 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 479 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 		 492 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 		 492 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 462 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  38.28 
 
 		 461 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 700 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 462 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 700 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 468 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  34.77 
 
 		 410 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 		 463 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 490 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  37.18 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 703 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  33.21 
 
 		 687 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.6 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  34.1 
 
 		 670 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 509 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 748 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 595 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 598 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 692 aa  123  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  32.58 
 
 		 680 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  41.78 
 
 		 594 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  37.18 
 
 		 464 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 619 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.5 
 
 		 1226 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 596 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  34.42 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  36.53 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0789  histidine kinase  36.52 
 
 		 273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  36.16 
 
 		 1809 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  32.82 
 
 		 680 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 1101 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  35.5 
 
 		 598 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  38.74 
 
 		 710 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  35.17 
 
 		 458 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  34.35 
 
 		 515 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  38.6 
 
 		 458 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 703 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  38.74 
 
 		 710 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 658 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>