More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7756 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  43.99 
 
 		 1663 aa  1213    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  41.54 
 
 		 1822 aa  1213    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  35.86 
 
 		 1685 aa  757    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  33.26 
 
 		 1644 aa  757    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  36.18 
 
 		 2051 aa  909    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  28.61 
 
 		 2303 aa  733    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  29.24 
 
 		 2279 aa  758    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  35.18 
 
 		 2361 aa  934    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.9 
 
 		 1780 aa  946    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.56 
 
 		 1901 aa  893    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.3 
 
 		 1805 aa  866    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  33.86 
 
 		 1934 aa  878    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.58 
 
 		 1804 aa  864    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.01 
 
 		 2017 aa  823    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.9 
 
 		 1794 aa  852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  34.36 
 
 		 1850 aa  879    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.9 
 
 		 1797 aa  836    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.31 
 
 		 1795 aa  851    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.86 
 
 		 1808 aa  858    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  46.54 
 
 		 1836 aa  1408    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.56 
 
 		 2109 aa  674    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  58.3 
 
 		 1845 aa  1860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  43.63 
 
 		 1668 aa  1205    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.32 
 
 		 1780 aa  705    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  35.5 
 
 		 1685 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 		 1914 aa  926    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  42.21 
 
 		 1833 aa  1377    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  33.1 
 
 		 1922 aa  739    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  41.99 
 
 		 1697 aa  1122    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  100 
 
 		 1809 aa  3709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  41.48 
 
 		 1712 aa  1095    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  58.81 
 
 		 1837 aa  2068    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.52 
 
 		 1748 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  30.37 
 
 		 2272 aa  767    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 1942 aa  878    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  31.51 
 
 		 2077 aa  863    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 		 1908 aa  868    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.71 
 
 		 1774 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  31.39 
 
 		 1871 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  31.7 
 
 		 1811 aa  810    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  35.52 
 
 		 1805 aa  952    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  35.7 
 
 		 1932 aa  941    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.2 
 
 		 1797 aa  613  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  31.68 
 
 		 1744 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  28.86 
 
 		 1739 aa  588  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  29.63 
 
 		 1685 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  29.4 
 
 		 1682 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  29.25 
 
 		 1682 aa  552  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  29.93 
 
 		 1710 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  29.41 
 
 		 1788 aa  515  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.51 
 
 		 1885 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  30.43 
 
 		 1756 aa  506  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  33.8 
 
 		 1885 aa  492  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 		 670 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 		 1637 aa  466  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.57 
 
 		 1832 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 1636 aa  423  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 1123 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 1629 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  26.42 
 
 		 1112 aa  335  6e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 1643 aa  321  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 		 1649 aa  312  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  64.04 
 
 		 748 aa  292  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 1726 aa  273  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  26.11 
 
 		 1064 aa  268  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.07 
 
 		 1060 aa  265  8e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  31.99 
 
 		 1123 aa  240  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  24.65 
 
 		 1473 aa  222  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  24.57 
 
 		 1473 aa  221  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  24.57 
 
 		 1473 aa  221  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 541 aa  219  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 1168 aa  217  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 		 546 aa  214  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 526 aa  211  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 739 aa  205  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  38.66 
 
 		 671 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 541 aa  204  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  38.26 
 
 		 670 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 		 1377 aa  196  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 553 aa  194  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 799 aa  194  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  25.39 
 
 		 1255 aa  193  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 801 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  44.03 
 
 		 795 aa  188  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  45.23 
 
 		 799 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  44.81 
 
 		 797 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 795 aa  186  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 795 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 795 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.26 
 
 		 683 aa  177  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  34.42 
 
 		 680 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  34.42 
 
 		 619 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  34.42 
 
 		 680 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 692 aa  175  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  34.07 
 
 		 687 aa  171  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 363 aa  170  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 703 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 671 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 363 aa  165  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  25.39 
 
 		 1774 aa  165  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>