More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0754 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 384 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  72.47 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.64 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.92 
 
 		 370 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.13 
 
 		 493 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3077  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 707 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 703 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 700 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 700 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 684 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 700 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 703 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 450 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  42.24 
 
 		 680 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  41.88 
 
 		 619 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  42.44 
 
 		 680 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  40.78 
 
 		 687 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 671 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  44.49 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  44.49 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  44.49 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  44.49 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  44.49 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  44.49 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 665 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  43.75 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  40.18 
 
 		 515 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 490 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  38.07 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 462 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 462 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 748 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  37.35 
 
 		 458 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  34.34 
 
 		 650 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  34.69 
 
 		 699 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 541 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 539 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 748 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.86 
 
 		 683 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 642 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4650  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 466 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3574  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 466 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 489 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 795 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 639 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 641 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 650 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 639 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 789 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 789 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 642 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 541 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 795 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 795 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 575 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  41.01 
 
 		 575 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.74 
 
 		 651 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  38.25 
 
 		 740 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 781 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  35.65 
 
 		 799 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 660 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 598 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  35.76 
 
 		 1809 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 807 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  40.91 
 
 		 598 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 789 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 		 784 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 653 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732563  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  36.64 
 
 		 678 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 776 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 815 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  37.15 
 
 		 795 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 		 526 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 553 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 595 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 766 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 596 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 662 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  35.58 
 
 		 797 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0506  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 573 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 546 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 799 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.55 
 
 		 891 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 529 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  39.26 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 650 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>