More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3575 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  83.58 
 
 		 481 aa  795    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 475 aa  952    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.75 
 
 		 488 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  63.6 
 
 		 488 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  62.37 
 
 		 487 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  58.76 
 
 		 456 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.5 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 		 459 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.51 
 
 		 459 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 		 459 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.19 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 486 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  52.94 
 
 		 470 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  52.97 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.97 
 
 		 480 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.97 
 
 		 480 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  53.07 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  53.07 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  53.07 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  52.85 
 
 		 466 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  52.85 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.72 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  52.85 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  52.85 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.91 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.05 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  52.4 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.65 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  50.88 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  47.72 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  48.12 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  49.66 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.24 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  43.49 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  41.01 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 485 aa  336  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 461 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  39.27 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  41.23 
 
 		 451 aa  315  8e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 480 aa  307  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  35.18 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  39.36 
 
 		 456 aa  295  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  32.05 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  41.26 
 
 		 287 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  35.48 
 
 		 564 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  36.91 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  40 
 
 		 447 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  33.73 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  32 
 
 		 643 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  41.1 
 
 		 489 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  38.12 
 
 		 497 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  37.78 
 
 		 515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  39.64 
 
 		 772 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  39.57 
 
 		 373 aa  126  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 564 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  32.73 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 357 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.5 
 
 		 640 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 312 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  35.59 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  35.59 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 700 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  36.49 
 
 		 683 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 775 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 585 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  35.5 
 
 		 1101 aa  124  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 508 aa  124  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 1229 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 554 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 526 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 703 aa  123  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 1226 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  35.71 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  37.14 
 
 		 557 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  31.18 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 640 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  37.78 
 
 		 598 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 695 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  36.65 
 
 		 783 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 598 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  39.9 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  31.67 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  37.17 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  37.22 
 
 		 799 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 658 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>