More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0581 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  67.73 
 
 		 554 aa  744    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.73 
 
 		 554 aa  744    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.91 
 
 		 554 aa  722    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.64 
 
 		 568 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.26 
 
 		 555 aa  715    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  68.67 
 
 		 554 aa  751    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.27 
 
 		 554 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.45 
 
 		 554 aa  727    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.52 
 
 		 554 aa  697    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.33 
 
 		 554 aa  748    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.92 
 
 		 554 aa  745    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.64 
 
 		 554 aa  727    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63 
 
 		 558 aa  700    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.27 
 
 		 554 aa  683    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.35 
 
 		 554 aa  741    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.23 
 
 		 554 aa  764    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.82 
 
 		 554 aa  725    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.45 
 
 		 554 aa  721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.61 
 
 		 554 aa  763    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 554 aa  1127    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  67.82 
 
 		 554 aa  725    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.23 
 
 		 554 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.64 
 
 		 554 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  41.32 
 
 		 564 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  42.48 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 564 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  35.29 
 
 		 561 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  35.12 
 
 		 561 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  34.77 
 
 		 553 aa  312  9e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  35.5 
 
 		 553 aa  310  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 		 560 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.51 
 
 		 559 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 560 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  33.45 
 
 		 545 aa  290  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 548 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  29.96 
 
 		 556 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 		 569 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 561 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.859036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  37.84 
 
 		 690 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  33.53 
 
 		 549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 544 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 558 aa  274  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 544 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 544 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.63 
 
 		 543 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 544 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  33.45 
 
 		 553 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 771 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.18 
 
 		 636 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 		 637 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 		 632 aa  260  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  35.08 
 
 		 545 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 		 716 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  33.83 
 
 		 549 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 546 aa  257  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.08 
 
 		 546 aa  256  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  32.14 
 
 		 558 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  39.5 
 
 		 578 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 626 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.37 
 
 		 548 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 		 687 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  32.67 
 
 		 543 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  40.28 
 
 		 712 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  40.28 
 
 		 712 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 		 565 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 545 aa  253  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 		 548 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  39.88 
 
 		 643 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  41.28 
 
 		 545 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 545 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.12 
 
 		 545 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 		 568 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 		 527 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 545 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 545 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  41.27 
 
 		 663 aa  249  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 545 aa  249  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 		 713 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 		 643 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.27 
 
 		 630 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 		 527 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.27 
 
 		 630 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  37.77 
 
 		 578 aa  246  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 		 527 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 		 647 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  35.7 
 
 		 630 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 		 525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  40.98 
 
 		 545 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.23 
 
 		 674 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 		 688 aa  243  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 		 627 aa  243  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 		 541 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 		 630 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>