More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0962 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 643 aa  1311    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.48 
 
 		 632 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 633 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3839  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 		 636 aa  350  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.406017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4711  methyl-accepting chemotaxis protein  33.54 
 
 		 633 aa  310  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  37.57 
 
 		 690 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 771 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  46.73 
 
 		 663 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  42.71 
 
 		 578 aa  289  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  42.44 
 
 		 578 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 		 687 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 		 688 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.95 
 
 		 554 aa  267  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.24 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.62 
 
 		 527 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.62 
 
 		 525 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.95 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 		 555 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.95 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 		 554 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.9 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.7 
 
 		 527 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.95 
 
 		 554 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 		 558 aa  263  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  32.81 
 
 		 627 aa  262  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.95 
 
 		 632 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 		 527 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 		 527 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 		 554 aa  260  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 		 554 aa  260  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 		 554 aa  260  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 		 527 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.6 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  41.09 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.6 
 
 		 568 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.6 
 
 		 554 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.6 
 
 		 554 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 627 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  29.58 
 
 		 627 aa  253  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 554 aa  253  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 554 aa  253  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 		 674 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  40.68 
 
 		 564 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 554 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.14 
 
 		 630 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.81 
 
 		 630 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 		 624 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.66 
 
 		 630 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.66 
 
 		 630 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 		 630 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  31.67 
 
 		 633 aa  238  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 		 630 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 		 630 aa  237  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 		 637 aa  237  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  40.39 
 
 		 557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  38.44 
 
 		 559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.64 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.84 
 
 		 631 aa  234  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 637 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 		 716 aa  233  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  39.16 
 
 		 561 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  34.79 
 
 		 561 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.14 
 
 		 627 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 		 634 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 		 634 aa  230  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.29 
 
 		 630 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  27.84 
 
 		 623 aa  229  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  38.69 
 
 		 560 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.93 
 
 		 560 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.79 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  30.78 
 
 		 623 aa  229  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.2 
 
 		 630 aa  229  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  30.95 
 
 		 712 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.28 
 
 		 626 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 713 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  32.57 
 
 		 553 aa  227  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  28.55 
 
 		 639 aa  226  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  26.82 
 
 		 627 aa  225  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 		 702 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  39.39 
 
 		 545 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 		 671 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  37.04 
 
 		 634 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 		 630 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  31.2 
 
 		 623 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.04 
 
 		 636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.7 
 
 		 626 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  30.02 
 
 		 712 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 541 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  30.34 
 
 		 628 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.63 
 
 		 628 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  29.2 
 
 		 626 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 568 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.36 
 
 		 626 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  26.8 
 
 		 625 aa  219  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.55 
 
 		 626 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>