More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07022 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  85.9 
 
 		 553 aa  986    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  100 
 
 		 553 aa  1127    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  67.27 
 
 		 553 aa  717    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  55.81 
 
 		 558 aa  609  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.93 
 
 		 561 aa  399  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.859036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 		 564 aa  363  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  35.42 
 
 		 559 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 560 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  36.61 
 
 		 561 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  36.07 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  36.09 
 
 		 564 aa  333  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  34.29 
 
 		 557 aa  333  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 		 560 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  36.28 
 
 		 557 aa  312  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 554 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.64 
 
 		 555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 		 554 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 558 aa  300  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 554 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 		 554 aa  296  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 554 aa  293  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 		 554 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 		 554 aa  291  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.45 
 
 		 548 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.03 
 
 		 568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.6 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 		 554 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  34.25 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.6 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 		 554 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.02 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 		 554 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.74 
 
 		 543 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  33.69 
 
 		 545 aa  267  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 569 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 544 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.95 
 
 		 544 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 557 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.418138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.53 
 
 		 544 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 		 563 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  35.19 
 
 		 543 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05646  histidine kinase  34.83 
 
 		 482 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 		 549 aa  250  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  43.48 
 
 		 546 aa  249  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 		 565 aa  250  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  41.97 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  41.97 
 
 		 712 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  30.53 
 
 		 556 aa  247  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 544 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 		 636 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 		 548 aa  243  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  32.31 
 
 		 541 aa  242  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 		 702 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 		 637 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  42.77 
 
 		 623 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 		 548 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 		 620 aa  240  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 568 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 		 638 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 		 620 aa  239  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 		 674 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 		 552 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 		 620 aa  237  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 		 716 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 773 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 		 638 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  41.97 
 
 		 623 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.6 
 
 		 545 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.24 
 
 		 584 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 		 638 aa  233  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  39.8 
 
 		 622 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 		 620 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 		 638 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 545 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 545 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 545 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.57 
 
 		 545 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.81 
 
 		 541 aa  229  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  34.29 
 
 		 690 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  40.57 
 
 		 545 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 637 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002443  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  31.41 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000057049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.63 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  34.19 
 
 		 639 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 		 541 aa  228  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 		 545 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 545 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 545 aa  226  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>