More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0085 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.43 
 
 		 638 aa  949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  76.8 
 
 		 642 aa  945    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.73 
 
 		 636 aa  875    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  75.16 
 
 		 639 aa  943    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.12 
 
 		 638 aa  942    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.59 
 
 		 638 aa  955    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.31 
 
 		 638 aa  999    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.43 
 
 		 638 aa  949    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 638 aa  1289    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.74 
 
 		 638 aa  959    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.13 
 
 		 638 aa  1038    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.8 
 
 		 636 aa  933    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.43 
 
 		 641 aa  950    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.43 
 
 		 638 aa  949    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.9 
 
 		 638 aa  960    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  52.03 
 
 		 638 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  50.55 
 
 		 650 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  49.45 
 
 		 638 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  42.43 
 
 		 636 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.1 
 
 		 641 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.471742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 		 640 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  35.73 
 
 		 641 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.37 
 
 		 640 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 645 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.03 
 
 		 645 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 645 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 645 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 		 645 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 643 aa  352  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 		 629 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  40.38 
 
 		 629 aa  310  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  39.96 
 
 		 629 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  37.74 
 
 		 629 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  39.87 
 
 		 632 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 		 625 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 		 548 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  38.27 
 
 		 632 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  35.58 
 
 		 629 aa  303  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1007  hemolysin secretion protein HylB  53.4 
 
 		 548 aa  300  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.702356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.19 
 
 		 630 aa  300  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  37.86 
 
 		 630 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.55 
 
 		 624 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  36.96 
 
 		 629 aa  297  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 626 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 		 548 aa  290  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.664947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  40.56 
 
 		 624 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  38.4 
 
 		 626 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.92 
 
 		 643 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 		 628 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.35 
 
 		 624 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.13 
 
 		 624 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.28 
 
 		 626 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.51 
 
 		 628 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 		 648 aa  279  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  32.62 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.61 
 
 		 637 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.29 
 
 		 638 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  33.44 
 
 		 623 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 		 629 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.72 
 
 		 626 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001368  methyl-accepting chemotaxis protein  39.23 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 		 558 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  34.56 
 
 		 623 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 		 634 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.45 
 
 		 631 aa  266  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  43.71 
 
 		 568 aa  266  8.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.72 
 
 		 637 aa  263  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  45.34 
 
 		 712 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.67 
 
 		 634 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  33.27 
 
 		 630 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 630 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 630 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 630 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.07 
 
 		 630 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 630 aa  260  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  44.32 
 
 		 634 aa  260  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 		 716 aa  260  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 630 aa  259  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 		 559 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 		 773 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3736  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 		 620 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.0212994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 		 620 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 630 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  33.28 
 
 		 712 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.74 
 
 		 647 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3785  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 		 620 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0060774  normal  0.0147123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 647 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  32.84 
 
 		 639 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.38 
 
 		 626 aa  253  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.24 
 
 		 541 aa  253  9.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.18 
 
 		 674 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  39.48 
 
 		 712 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 		 636 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.17 
 
 		 540 aa  251  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 630 aa  250  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 		 713 aa  250  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  31.97 
 
 		 633 aa  249  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.56 
 
 		 545 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 		 634 aa  249  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.95 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>