More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1439 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 641 aa  1298    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.12 
 
 		 640 aa  822    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.53 
 
 		 640 aa  858    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 643 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 		 645 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 638 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 638 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 641 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 645 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 638 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 645 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 645 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.73 
 
 		 638 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 636 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  35.98 
 
 		 642 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 		 645 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 		 638 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 		 638 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 		 639 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 638 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 638 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 		 636 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 638 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 		 638 aa  360  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  33.84 
 
 		 648 aa  342  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  34.26 
 
 		 636 aa  337  5e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  32.76 
 
 		 638 aa  333  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  32.24 
 
 		 638 aa  323  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3723  HAMP domain-containing protein  31.22 
 
 		 628 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 634 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.13 
 
 		 650 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0552  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 		 648 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283806  decreased coverage  0.00439756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 		 620 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3736  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 		 620 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.0212994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3785  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 		 620 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0060774  normal  0.0147123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.52 
 
 		 641 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.471742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  36.03 
 
 		 629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  36.03 
 
 		 629 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  33.91 
 
 		 628 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4997  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.09 
 
 		 620 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.245568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 620 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 		 620 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.407039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  31.65 
 
 		 629 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  29.4 
 
 		 628 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 620 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0344374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 		 627 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  30.17 
 
 		 628 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  30.99 
 
 		 629 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 		 625 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  32.55 
 
 		 646 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 		 622 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.76 
 
 		 648 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.55 
 
 		 647 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.55 
 
 		 647 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 646 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  32.14 
 
 		 632 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 		 713 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.31 
 
 		 626 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  31.52 
 
 		 632 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  30.19 
 
 		 712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  33.19 
 
 		 639 aa  244  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  34.67 
 
 		 629 aa  244  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.02 
 
 		 626 aa  243  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  31.91 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  30.31 
 
 		 712 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.97 
 
 		 647 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  31.81 
 
 		 623 aa  240  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 630 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 630 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.96 
 
 		 630 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  33.26 
 
 		 630 aa  239  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.47 
 
 		 630 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 630 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.49 
 
 		 624 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 630 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.86 
 
 		 628 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 628 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  39.07 
 
 		 545 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 		 671 aa  233  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  30.73 
 
 		 633 aa  233  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.77 
 
 		 630 aa  232  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.26 
 
 		 630 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 		 541 aa  231  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.49 
 
 		 541 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 		 623 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.26 
 
 		 630 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.6 
 
 		 626 aa  230  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 624 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.14 
 
 		 624 aa  230  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  28.26 
 
 		 643 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 		 716 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  40.54 
 
 		 545 aa  230  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 637 aa  229  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 		 634 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.26 
 
 		 630 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.36 
 
 		 624 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  28.62 
 
 		 629 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 		 630 aa  229  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.38 
 
 		 623 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>