More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1371 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  100 
 
 		 624 aa  1268    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  61.49 
 
 		 643 aa  760    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.77 
 
 		 625 aa  879    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  61.31 
 
 		 628 aa  755    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  60.06 
 
 		 626 aa  721    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  61.75 
 
 		 630 aa  749    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  59.55 
 
 		 629 aa  723    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  68.52 
 
 		 629 aa  852    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  66.93 
 
 		 629 aa  846    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  93.91 
 
 		 624 aa  1149    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  59.68 
 
 		 626 aa  719    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  60.67 
 
 		 629 aa  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  63.91 
 
 		 629 aa  776    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  60.54 
 
 		 626 aa  746    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  65.45 
 
 		 630 aa  796    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  60.93 
 
 		 626 aa  728    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  75.04 
 
 		 629 aa  920    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  62.66 
 
 		 632 aa  793    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  98.24 
 
 		 624 aa  1249    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.2 
 
 		 624 aa  1259    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  63.13 
 
 		 632 aa  800    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  68.36 
 
 		 629 aa  850    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  66.77 
 
 		 629 aa  845    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.46 
 
 		 628 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 		 627 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 626 aa  359  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  32.48 
 
 		 623 aa  325  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  33.11 
 
 		 623 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  35.73 
 
 		 623 aa  320  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.19 
 
 		 622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.56 
 
 		 622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  31.47 
 
 		 695 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  33.06 
 
 		 652 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 		 630 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.3 
 
 		 638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.28 
 
 		 630 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 		 630 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 630 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 638 aa  306  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 630 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 630 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 630 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  35.81 
 
 		 626 aa  301  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  32.44 
 
 		 630 aa  300  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.46 
 
 		 622 aa  300  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 		 638 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.97 
 
 		 632 aa  297  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 		 639 aa  297  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 636 aa  296  9e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 		 623 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 		 626 aa  292  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.45 
 
 		 630 aa  289  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.54 
 
 		 623 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.38 
 
 		 623 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  31.53 
 
 		 623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 623 aa  283  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.28 
 
 		 623 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.01 
 
 		 631 aa  281  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 		 636 aa  280  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 630 aa  280  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 623 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.06 
 
 		 623 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0193  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 623 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.06 
 
 		 623 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  35.21 
 
 		 627 aa  277  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  38.26 
 
 		 638 aa  276  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 		 623 aa  273  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.39 
 
 		 626 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.39 
 
 		 596 aa  270  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  36.42 
 
 		 559 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  33.52 
 
 		 639 aa  269  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  39.92 
 
 		 642 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.39 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  34.05 
 
 		 627 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 		 638 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 		 638 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  31.9 
 
 		 633 aa  267  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.44 
 
 		 623 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 638 aa  267  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.62 
 
 		 650 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 638 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 638 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 641 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 638 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.92 
 
 		 638 aa  263  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 		 640 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1003  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.86 
 
 		 596 aa  259  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.98 
 
 		 632 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.19 
 
 		 632 aa  258  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.62 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  30.96 
 
 		 624 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.68 
 
 		 627 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  35.57 
 
 		 638 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  32.63 
 
 		 626 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.69 
 
 		 599 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  29.25 
 
 		 628 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.36 
 
 		 645 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  37.32 
 
 		 561 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.36 
 
 		 645 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>